79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4854 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4854  putative transcriptional regulator, RpiR family  100 
 
 		 108 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.184524  normal  0.0902185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3957  RpiR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 278 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2412  transcriptional regulator, RpiR family  42.47 
 
 		 285 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3563  RpiR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.123663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1136  transcriptional regulator, RpiR family  34.88 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0983  transcriptional regulator, RpiR family  34.88 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3546  RpiR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1589  RpiR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  44.26 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5296  putative transcriptional regulator, RpiR family  36.71 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2833  RpiR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 311 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50020  Sugar isomerase (SIS)  34.52 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49920  Sugar isomerase (SIS)  34.52 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3275  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  36.84 
 
 		 287 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0499663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3344  transcriptional regulator, RpiR family  38.16 
 
 		 285 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3501  transcriptional regulator, RpiR family  35.53 
 
 		 302 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.671277  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2067  RpiR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3051  RpiR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 284 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2978  RpiR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 284 aa  50.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1878  RpiR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 284 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289496 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0304  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2326  RpiR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1333  transcriptional regulator, RpiR family  34.21 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3004  transcriptional regulator, RpiR family  34.21 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4368  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 334 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.832437  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2602  RpiR family transcriptional regulator  30 
 
 		 285 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0986  RpiR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 299 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1596  RpiR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 293 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1590  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 287 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3797  RpiR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 305 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0556618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5469  transcriptional regulator, RpiR family  32.5 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2805  transcriptional regulator, RpiR family  33.73 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531351  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1140  RpiR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0292  transcriptional regulator, RpiR family  34.18 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  36.84 
 
 		 320 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0584  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 		 288 aa  42.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0730  RpiR family transcriptional regulator  33 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0917  SIS domain-containing protein  33 
 
 		 375 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.920257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1033  RpiR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 305 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1681  RpiR family transcriptional regulator  33 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4058  RpiR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369796  normal  0.143797 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1659  RpiR family transcriptional regulator  33 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153361  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0432  RpiR family transcriptional regulator  33 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.292279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1835  SIS domain-containing protein  33 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1448  RpiR family transcriptional regulator  33 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3695  RpiR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1042  RpiR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0343  RpiR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 298 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3287  RpiR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 292 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0245  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 287 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.612405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2796  RpiR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 292 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1350  RpiR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 294 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0051  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  32.5 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000270259  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5218  RpiR family transcriptional regulator  30 
 
 		 286 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.398124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0235  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 287 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0836166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1764  SIS domain-containing protein  32.5 
 
 		 286 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000384783  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2643  SIS domain-containing protein  33.78 
 
 		 293 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.574546  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 315 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0225  RpiR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 287 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23580  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 310 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  40.74 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2209  putative DNA-binding protein  32.5 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00094108  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0831  hypothetical protein  32.5 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111957  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1249  hypothetical protein  37.04 
 
 		 302 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0959  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  32.5 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00212362  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0867  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  32.5 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574279  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1569  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  32.5 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00731797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  41.67 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4303  transcriptional regulator, RpiR family  40 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3158  transcriptional regulator, RpiR family  35.62 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0673923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1330  RpiR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 278 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2619  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 286 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0949  RpiR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 319 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1431  RpiR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 319 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1338  RpiR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 291 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.298228  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1149  RpiR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 291 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0445331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1409  RpiR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 294 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1311  RpiR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 294 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>