More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02362 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02362  putative amino-acid efflux transmembrane protein  100 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0502342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1885  efflux protein, LysE family  34.5 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0676486  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1900  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.607568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3307  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161693  normal  0.0723567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2388  amino acid transporter LysE  33.86 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1994  lysine exporter protein LysE/YggA  33.86 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1448  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6380  lysine exporter protein LysE/YggA  35.26 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7044  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290852  normal  0.28612 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6922  lysine exporter family protein  31.58 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.28 
 
 		 208 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  32.3 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.55 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  29.34 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  29 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  29 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  29 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  29 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  29 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  29 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.81 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.07 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  29.14 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  28.16 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  28.65 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3860  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000283394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  32.02 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  30.88 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28.42 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  30.87 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  29.27 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.98 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  30.53 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  29.81 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4206  lysine exporter protein LysE/YggA  26.98 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  28.48 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  26.9 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  29.09 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.64 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  26.96 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  27.33 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4912  lysine exporter protein LysE/YggA  24.74 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.15938 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.23 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  27.27 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  31.91 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  29.94 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  26.63 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.29 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  27.33 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  26.63 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  28.48 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  26.37 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  26.8 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  34.06 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3218  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.74737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  27.27 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2367  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.01403  normal  0.272564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1669  lysine exporter protein LysE/YggA  25.63 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  27.81 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.23 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2295  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1489  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.98 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  28.48 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  26.67 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3276  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.667965  normal  0.54958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4194  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288447  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  27.22 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4067  lysine exporter protein LysE/YggA  30.86 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.67 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  30.86 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.67 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4501  lysine exporter protein (LysE/YggA)  23.4 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000135665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2328  lysine exporter protein LysE/YggA  27.44 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49697  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3118  lysine exporter protein LysE/YggA  26.43 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  34.84 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  27.87 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4254  lysine exporter protein LysE/YggA  23.89 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  27.27 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  34.84 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.47 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  34.84 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.72 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0589  lysine exporter protein LysE/YggA  31.48 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.332846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  32.12 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1186  putative lysine exporter protein  26.28 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>