More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6380 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6380  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 216 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1448  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 216 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7044  lysine exporter protein LysE/YggA  97.22 
 
 		 216 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290852  normal  0.28612 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6922  lysine exporter family protein  87.56 
 
 		 216 aa  348  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1900  lysine exporter protein LysE/YggA  42.51 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.607568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1885  efflux protein, LysE family  40.1 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0676486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2388  amino acid transporter LysE  41.24 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1994  lysine exporter protein LysE/YggA  41.24 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3307  lysine exporter protein LysE/YggA  41.24 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161693  normal  0.0723567 
 
 
-
 
NC_003296  RS02362  putative amino-acid efflux transmembrane protein  35.21 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0502342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.03 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.95 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.81 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.52 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.05 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.67 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.67 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  29.8 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  30.1 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  32.62 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.81 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.19 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.34 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.72 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.95 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6863  efflux protein  31.68 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  29.94 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  28.22 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.06 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.06 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.06 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.06 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.87 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.87 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  32.43 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  30.87 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3631  amino acid transporter LysE  30 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  41.05 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4833  lysine exporter protein LysE/YggA  27.78 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  30.14 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  25.39 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  31.64 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.89 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  32.98 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  30.87 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.94 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.04 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  28.37 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.1 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.7 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.63 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.12 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  27.49 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.25 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.94 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3218  lysine exporter protein LysE/YggA  30.86 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  34.55 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  24.4 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  26.67 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  25.82 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  30.36 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  33.33 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  29.48 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4067  lysine exporter protein LysE/YggA  31.06 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  27.14 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  31.06 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  30.61 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  25.82 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  26.88 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  26.67 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  26.67 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  25.37 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.59 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.76 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>