More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6922 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6922  lysine exporter family protein  100 
 
 
216 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405511  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7044  lysine exporter protein LysE/YggA  89.8 
 
 
216 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290852  normal  0.28612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1448  lysine exporter protein LysE/YggA  87.96 
 
 
216 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6380  lysine exporter protein LysE/YggA  87.96 
 
 
216 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1900  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.607568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1885  efflux protein, LysE family  42.08 
 
 
213 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0676486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2388  amino acid transporter LysE  41.24 
 
 
208 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209394  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3307  lysine exporter protein LysE/YggA  41.24 
 
 
208 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161693  normal  0.0723567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1994  lysine exporter protein LysE/YggA  39.8 
 
 
208 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02362  putative amino-acid efflux transmembrane protein  32.87 
 
 
207 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0502342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  32.83 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  33.84 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 
207 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.9 
 
 
208 aa  89  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.89 
 
 
208 aa  88.2  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.78 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  30.3 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  30.5 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4833  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.88 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3631  amino acid transporter LysE  30.85 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  30.51 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  29.19 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  37.27 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.96 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.24 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6863  efflux protein  31.22 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286077  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  30.14 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  30.14 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  30.14 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  30.14 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.14 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  30.14 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  30.14 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  32.19 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  29.21 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.34 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3218  lysine exporter protein LysE/YggA  32.72 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.46 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0367  lysine exporter protein LysE/YggA  32.2 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  28.28 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  27.03 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  29.94 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4067  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  33.13 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.26 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.17 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0322  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279488  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.07 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.17 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  26.44 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  26.26 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3040  lysine exporter protein LysE/YggA  33.74 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.408857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5326  lysine exporter protein LysE/YggA  33.74 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.692371  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  28.31 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  25.71 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.64 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  25.79 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  30.41 
 
 
222 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.37 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4942  lysine exporter protein LysE/YggA  33.74 
 
 
208 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.20679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  30.5 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.65 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2358  putative lysine exporter protein  30.99 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  31.29 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4194  lysine exporter protein LysE/YggA  32.05 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288447  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  28.41 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.62 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.9 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
208 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  29.41 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  31.74 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  30.18 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.84 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.12 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  24.43 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  30.5 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  30.39 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  29.14 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>