More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1994 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1994  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2388  amino acid transporter LysE  96.63 
 
 		 208 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.209394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3307  lysine exporter protein LysE/YggA  96.15 
 
 		 208 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161693  normal  0.0723567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1900  lysine exporter protein LysE/YggA  91.79 
 
 		 208 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.607568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1885  efflux protein, LysE family  49.51 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0676486  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6922  lysine exporter family protein  40.1 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7044  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290852  normal  0.28612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1448  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6380  lysine exporter protein LysE/YggA  40.96 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02362  putative amino-acid efflux transmembrane protein  33.86 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0502342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  31.64 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.72 
 
 		 208 aa  84.7  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  35.85 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1344  putative threonine efflux protein  30.1 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.115554  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  32.92 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  33.04 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.38 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.7 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.19 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.75 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  26.99 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4441  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.83 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.568773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.5 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  27.67 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.45 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3631  amino acid transporter LysE  31.33 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  28.12 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  27.91 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  33.1 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.01 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4577  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.51 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.49 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.64 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.04 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  34.76 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0131  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.14 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  32.64 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  32.64 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  32.09 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.09 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  32.09 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  32.09 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2393  lysine exporter protein LysE/YggA  29.24 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  28.08 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  28.49 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  30.3 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  28.29 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.83 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1071  putative RhtB protein  28.5 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.49 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4833  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  28.29 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1710  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4157  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  33.58 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  30.61 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000642  transporter LysE family  33.33 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  29.06 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  27.96 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  25.73 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1504  RhtB family transporter  28.28 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672768 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  27.86 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  29.58 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  29.06 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  27.96 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  27.96 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1795  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  27.42 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  27.42 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  30.46 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  27.66 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  27.42 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  32.84 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  30.82 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  30.11 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6863  efflux protein  30.86 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  28.49 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  28.49 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  28.49 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  28.1 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  28.49 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.9 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  28.49 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  28.49 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  28.49 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>