More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2164 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2164  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2113  heme exporter protein CcmA  71.57 
 
 
213 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1829  ABC exporter, ATPase subunit CcmA  72.64 
 
 
209 aa  299  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  38.43 
 
 
223 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.15 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  38.97 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.16 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.16 
 
 
210 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.91 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.78 
 
 
211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.63 
 
 
210 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.55 
 
 
233 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.58 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.09 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.57 
 
 
214 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.87 
 
 
219 aa  123  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.79 
 
 
205 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  41.79 
 
 
205 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.79 
 
 
205 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.79 
 
 
205 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.79 
 
 
205 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.79 
 
 
205 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  41.79 
 
 
207 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  41.79 
 
 
207 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.79 
 
 
205 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.03 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.54 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.31 
 
 
207 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1413  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40 
 
 
210 aa  118  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.09 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.19 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  36.71 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  37.89 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.34 
 
 
208 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.13 
 
 
221 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  37.5 
 
 
205 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  41.49 
 
 
188 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.34 
 
 
208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.23 
 
 
207 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.23 
 
 
207 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  35.75 
 
 
220 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.82 
 
 
216 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  40.61 
 
 
212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.23 
 
 
207 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.86 
 
 
208 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.86 
 
 
208 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.76 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  39.5 
 
 
236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.2 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.27 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.76 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.76 
 
 
207 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.22 
 
 
204 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0447  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.41 
 
 
210 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0459  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.81 
 
 
212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.573877  normal  0.123941 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  36.87 
 
 
213 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  35.48 
 
 
215 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.88 
 
 
205 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.17 
 
 
200 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1683  heme exporter protein CcmA  37.56 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1801  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.41 
 
 
210 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.29 
 
 
211 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.14 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.92 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  34.48 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.44 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.82 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.08 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.99 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.23 
 
 
215 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.99 
 
 
216 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.79 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.79 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.1 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.33 
 
 
216 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.33 
 
 
216 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.33 
 
 
216 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.33 
 
 
216 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.27 
 
 
217 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  34.72 
 
 
202 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.43 
 
 
218 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  34.27 
 
 
225 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.1 
 
 
218 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.92 
 
 
209 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.74 
 
 
216 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.27 
 
 
226 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.26 
 
 
216 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.98 
 
 
214 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00865  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.98 
 
 
214 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.26 
 
 
216 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  36.5 
 
 
201 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2647  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.56 
 
 
211 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122197  normal  0.0114626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.38 
 
 
227 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0999  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.93 
 
 
204 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15365  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  32.49 
 
 
376 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.74 
 
 
216 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.5 
 
 
202 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 
343 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  35.2 
 
 
329 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.78 
 
 
215 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>