64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2356 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2356  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  892    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.67 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.4 
 
 		 584 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.24 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1333  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.18 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 		 526 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  29.35 
 
 		 514 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  27.65 
 
 		 525 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  27.6 
 
 		 482 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  26.11 
 
 		 772 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  30.06 
 
 		 529 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  29.56 
 
 		 503 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.98 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  26.07 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  26.51 
 
 		 407 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  31.58 
 
 		 501 aa  47.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0142  chymotrypsin serine protease  30.37 
 
 		 260 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  26.24 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 		 319 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  26.45 
 
 		 418 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  26.67 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  26.6 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  28.75 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  27.89 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  27.92 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  30.38 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30.77 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  25.21 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  27.4 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  26.98 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.28 
 
 		 752 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  27.43 
 
 		 473 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  27.8 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  27.09 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  26.98 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  26.98 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  26.98 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  26.98 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.03 
 
 		 545 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  26.98 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  26.98 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  24.72 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  26.5 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  27.95 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.64 
 
 		 337 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  27.95 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  28.12 
 
 		 524 aa  43.9  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2849  serine protease, DO/DeqQ family  26.4 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489599  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  24.24 
 
 		 504 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  26.7 
 
 		 477 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  28.66 
 
 		 508 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2470  protease Do  26.4 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.769337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  27.89 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.99 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1607  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.26 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0642705  normal  0.0199197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  25.88 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  28.1 
 
 		 477 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  26.09 
 
 		 504 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  27.71 
 
 		 514 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  27.71 
 
 		 514 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.84 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  28.57 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>