More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3712 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 361 aa  727    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  35.59 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.39 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.61 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  38.32 
 
 		 508 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  32.2 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  32.2 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  32.26 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  32.29 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  31.64 
 
 		 524 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  35.56 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  32.08 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.3 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  31.05 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.47 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  32 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.81 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  33.01 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  30.77 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  31.65 
 
 		 498 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  31.96 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.86 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  35.63 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.53 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  31.48 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.84 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2185  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.49 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  34.73 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  27.67 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  30.16 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  32.63 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.45 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  31.25 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  34.91 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  34.73 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  27.9 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  31.25 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  27.9 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  27.9 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  33.93 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.17 
 
 		 916 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  27.97 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  33.71 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  27.9 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  27.46 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  32.93 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  27.9 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.08 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  32.93 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  27.9 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  27.9 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  31.55 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.46 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  33.9 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  31.77 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.96 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.07 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.17 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.45 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.45 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  28.17 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  34.73 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.43 
 
 		 381 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  27.47 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  27.47 
 
 		 490 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2356  hypothetical protein  41.67 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  31.58 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  30.68 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  27.47 
 
 		 498 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  27.47 
 
 		 499 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0754  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.12 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  35.26 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  35.26 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  28.74 
 
 		 476 aa  67  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  35.33 
 
 		 495 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  33.53 
 
 		 505 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  27.47 
 
 		 498 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  27.47 
 
 		 499 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  27.47 
 
 		 498 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.44 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  33.53 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  33.13 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  28.68 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  26.57 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  33.53 
 
 		 502 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  32.04 
 
 		 514 aa  66.6  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  31.18 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  34.13 
 
 		 503 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  32.04 
 
 		 514 aa  66.2  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  31.74 
 
 		 476 aa  65.9  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  32.93 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  31.9 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  26.64 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  26.64 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  27.73 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>