99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0809 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0809  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  523  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  37.14 
 
 
129 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  35 
 
 
144 aa  52  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40.32 
 
 
142 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.71 
 
 
142 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
147 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  35.44 
 
 
153 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
147 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  33.77 
 
 
160 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  39.68 
 
 
122 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  37.33 
 
 
209 aa  48.9  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  36.67 
 
 
138 aa  48.9  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  33.33 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  45.07 
 
 
131 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  41.54 
 
 
152 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  32.5 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  32.1 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  34.21 
 
 
144 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
156 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  36.62 
 
 
219 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 
143 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
126 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  33.78 
 
 
151 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 
161 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 
150 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.66 
 
 
145 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.92 
 
 
157 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 
157 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  34.92 
 
 
145 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  33.33 
 
 
149 aa  46.2  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
144 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  34.43 
 
 
124 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  35.29 
 
 
213 aa  45.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.37 
 
 
146 aa  45.4  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  28.75 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 
161 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 
124 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  32.26 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  32.5 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
146 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  32.5 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
153 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  32.5 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  32.5 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  33.87 
 
 
124 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  34.25 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  33.87 
 
 
128 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  32.79 
 
 
128 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5269  general secretory pathway protein  34.38 
 
 
192 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  31.94 
 
 
133 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 
166 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
150 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  30.16 
 
 
135 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 
146 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  35.48 
 
 
124 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  37.29 
 
 
133 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  26.47 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  32.26 
 
 
124 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
144 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
150 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0394  hypothetical protein  34.92 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 
139 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1104  prepilin-type cleavage/methylation  34.43 
 
 
176 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.945124  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  35.59 
 
 
133 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
145 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  32.79 
 
 
323 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  28.21 
 
 
352 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  27.5 
 
 
158 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.51 
 
 
142 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  25.4 
 
 
146 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  39.29 
 
 
138 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  34.92 
 
 
162 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  29.73 
 
 
141 aa  42.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  33.87 
 
 
149 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  33.87 
 
 
149 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  31.82 
 
 
129 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  35.59 
 
 
129 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  29.23 
 
 
144 aa  42  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 
150 aa  42  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  32.26 
 
 
143 aa  42  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
144 aa  42  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  31.43 
 
 
130 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>