150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02041 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  53.91 
 
 
261 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  53.91 
 
 
261 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  55.28 
 
 
261 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  56.78 
 
 
260 aa  274  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  53.52 
 
 
260 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  53.52 
 
 
260 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  55.6 
 
 
260 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  53.91 
 
 
260 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  55.6 
 
 
260 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  55.6 
 
 
260 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  53.31 
 
 
260 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  54.31 
 
 
263 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  57.27 
 
 
220 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  45.06 
 
 
257 aa  246  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  36.4 
 
 
237 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  36.12 
 
 
237 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  34.78 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  35.06 
 
 
238 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  35.22 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  34.96 
 
 
238 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  35.48 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  30.88 
 
 
293 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  30.91 
 
 
291 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  34.38 
 
 
440 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  28.09 
 
 
452 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  34.02 
 
 
438 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  34.02 
 
 
438 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  34.02 
 
 
438 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  34.02 
 
 
438 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  34.02 
 
 
438 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  34.02 
 
 
438 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  34.02 
 
 
438 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  34.02 
 
 
437 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  27.94 
 
 
289 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  27.94 
 
 
289 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  31.79 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  28.22 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  31.21 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  31.44 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.84 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  31.61 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  29.88 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  24.66 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  28.57 
 
 
415 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  30.66 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  33.9 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.72 
 
 
463 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  29.02 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  32.45 
 
 
449 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  27.43 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  28.14 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.48 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  24.19 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.86 
 
 
456 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  33.8 
 
 
460 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  24.22 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  26.95 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  31.48 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  32.94 
 
 
453 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  24.22 
 
 
282 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  32.94 
 
 
453 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  29.08 
 
 
426 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  29.83 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  29.08 
 
 
421 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  23.3 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  29.08 
 
 
421 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  29.08 
 
 
421 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  29.08 
 
 
421 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  29.08 
 
 
421 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  29.08 
 
 
421 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  29.83 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  26.13 
 
 
493 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.54 
 
 
494 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  25.71 
 
 
430 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  36.45 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  23.48 
 
 
290 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.9 
 
 
219 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.23 
 
 
258 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.64 
 
 
258 aa  62  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  23.48 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.17 
 
 
258 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  31.03 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  29.38 
 
 
374 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  38.89 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  25.56 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  25 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  40.74 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  25.56 
 
 
289 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  23.7 
 
 
310 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  39.13 
 
 
226 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  27.22 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  39 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  28.08 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  25.25 
 
 
469 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  27.19 
 
 
443 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  27.48 
 
 
221 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  37.21 
 
 
224 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.97 
 
 
404 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>