76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3403 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  60.71 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  59.92 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  56.67 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  30.38 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1716  hypothetical protein  33.58 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  34.34 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  31.15 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  26.16 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  34.07 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  30.16 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  36.67 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  28.1 
 
 		 469 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  36.36 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  32.93 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.4 
 
 		 429 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.53 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.53 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.94 
 
 		 404 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  28.66 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  30.68 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  32.35 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  29.05 
 
 		 460 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  33.33 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  31.25 
 
 		 430 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  37.84 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  30.34 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  32.26 
 
 		 374 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  30.59 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  30.59 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  29.48 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  30.23 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.51 
 
 		 442 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  29.48 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  27.92 
 
 		 463 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  30.69 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  29.17 
 
 		 430 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  30.69 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  31.46 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  32.95 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  29.41 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  30.34 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  28.9 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  29.7 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  26.72 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  26.83 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  26.83 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  23.33 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.09 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  26.83 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  29.21 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  32.56 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 404 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.82 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  26.67 
 
 		 415 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  26.72 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  36.96 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  28.83 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  31.37 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  31.37 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  31.82 
 
 		 405 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  31.37 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  31.37 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  27.16 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  31.37 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  31.37 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  31.37 
 
 		 437 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  31.37 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  27.16 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  25.83 
 
 		 253 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  25.83 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  25.83 
 
 		 253 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  25.74 
 
 		 443 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>