85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5995 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1716  hypothetical protein  74.09 
 
 		 250 aa  337  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  30.38 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  30.13 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  32.76 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  32.76 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  29.38 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.91 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.29 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  28.1 
 
 		 460 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  28.37 
 
 		 460 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.29 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  24.09 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.32 
 
 		 429 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  25.93 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  26.49 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  24.46 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  24.62 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  29.06 
 
 		 440 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  26.32 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  22.3 
 
 		 469 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.2 
 
 		 494 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  26.56 
 
 		 430 aa  52.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  28 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  25.73 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  32.14 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  26.03 
 
 		 429 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  27.2 
 
 		 437 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.04 
 
 		 489 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  25.73 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  32.98 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  22.56 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  23.91 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  22.56 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  21.6 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  28.97 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  25.58 
 
 		 430 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  29.35 
 
 		 453 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  20.99 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  26.02 
 
 		 434 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  23.08 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  20.99 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  23.08 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  24.28 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  26.67 
 
 		 413 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  20.83 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.52 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  26.02 
 
 		 434 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  26.02 
 
 		 434 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  26.02 
 
 		 434 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  22.32 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  22.75 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  34.04 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  33.72 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.93 
 
 		 327 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  25.15 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  25.93 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  32.04 
 
 		 438 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  29.17 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  31.17 
 
 		 463 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  22.4 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  23.26 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  23.2 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  26.13 
 
 		 404 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  29.82 
 
 		 449 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  26.97 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  22.68 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  25.56 
 
 		 414 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  23.3 
 
 		 456 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  28.16 
 
 		 449 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0501  hypothetical protein  26.15 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0525  hypothetical protein  26.15 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  26.97 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  26.97 
 
 		 238 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  23.42 
 
 		 434 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  28.05 
 
 		 263 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>