88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1716 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1716  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  74.09 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  35.09 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  35.09 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  31.01 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.27 
 
 		 442 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.33 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.33 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  34.86 
 
 		 460 aa  58.9  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  28.42 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  26.16 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  34.78 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.78 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  27.87 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  26.47 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  27.57 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  29.55 
 
 		 452 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  27.17 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  23.7 
 
 		 429 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  27.17 
 
 		 289 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  28.24 
 
 		 443 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  27.07 
 
 		 460 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  31.03 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  26.53 
 
 		 430 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  32.99 
 
 		 453 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  24.56 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  32.63 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  27.78 
 
 		 463 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  32.29 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  29.66 
 
 		 440 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  28.12 
 
 		 434 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  36.17 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  26.24 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  26.24 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  31.45 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  27.1 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  25.53 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  25.53 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  25.78 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  27.42 
 
 		 430 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  29.59 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  27.21 
 
 		 431 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  30.84 
 
 		 449 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  30.84 
 
 		 449 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  30.49 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  28.37 
 
 		 434 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  27.78 
 
 		 438 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  27.5 
 
 		 432 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  24.39 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  29.87 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  29.19 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.95 
 
 		 327 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  24.56 
 
 		 443 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.04 
 
 		 456 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.53 
 
 		 404 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.63 
 
 		 489 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  28.37 
 
 		 434 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  28.37 
 
 		 434 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  28.37 
 
 		 434 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  26.98 
 
 		 437 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 404 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  28.71 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  23.53 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  27.53 
 
 		 421 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  27.53 
 
 		 421 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  27.53 
 
 		 421 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  25 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  31.46 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  26.29 
 
 		 421 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  26.29 
 
 		 421 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  26.29 
 
 		 421 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  26.58 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.19 
 
 		 494 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  26.86 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  26.29 
 
 		 426 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  21.62 
 
 		 374 aa  42  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  24.36 
 
 		 260 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>