121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3046 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  93.61 
 
 		 219 aa  417  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  51.61 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  43.78 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  41.77 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0731  hypothetical protein  40.12 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.696418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0546  hypothetical protein  40.12 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0618  hypothetical protein  40.12 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433758  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0729  hypothetical protein  40.12 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058958  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2039  hypothetical protein  40.12 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1687  hypothetical protein  40.12 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2137  hypothetical protein  39.53 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  29.03 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  26.27 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.43 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  34.43 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  33.61 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  31.97 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  31.97 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  31.34 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  31.34 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  33.61 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  31.34 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  32.79 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  26.04 
 
 		 430 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  28.04 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  30.88 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0554  hypothetical protein  31.4 
 
 		 441 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.404034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  27.46 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  31.03 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  30.15 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  29.09 
 
 		 434 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.11 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  29.09 
 
 		 434 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  29.09 
 
 		 434 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  29.09 
 
 		 434 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  24.49 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  32.11 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  29.31 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.11 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  31.53 
 
 		 453 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1716  hypothetical protein  34.78 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  28.48 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  27.61 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  24.57 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  27.61 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  24.57 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  24.57 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  38.2 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  34.95 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  24.57 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  27.23 
 
 		 443 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  31.67 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  32.2 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  24 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  30.68 
 
 		 289 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  30.68 
 
 		 289 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  30.11 
 
 		 293 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  38.1 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  26 
 
 		 440 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  27.1 
 
 		 430 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  31.33 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  31.33 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  27.15 
 
 		 449 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  25.37 
 
 		 257 aa  49.3  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  24.68 
 
 		 413 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  24.82 
 
 		 452 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  22.73 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  36.05 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.84 
 
 		 442 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  29.17 
 
 		 449 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  25.95 
 
 		 463 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  25.37 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  21.97 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  24.02 
 
 		 433 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  30.43 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  25 
 
 		 437 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  37.08 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  24.2 
 
 		 460 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  23.46 
 
 		 434 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  22.5 
 
 		 433 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  22.5 
 
 		 433 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  22.5 
 
 		 433 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  37.08 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  26.32 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 		 453 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  21.94 
 
 		 436 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  30.23 
 
 		 282 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>