99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0016 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  26.27 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  31.82 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.84 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0618  hypothetical protein  35.43 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433758  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0546  hypothetical protein  35.43 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2039  hypothetical protein  35.43 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0731  hypothetical protein  35.43 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.696418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1687  hypothetical protein  35.43 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0729  hypothetical protein  35.43 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058958  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2137  hypothetical protein  35.43 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202208  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  29.34 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  30 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  32.03 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  28.4 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.48 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  34.34 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  34.34 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  28.77 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  29.69 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  25.43 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 463 aa  58.2  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  30.69 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  30.91 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  26.16 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  29.81 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  28.33 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  30.4 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  30.4 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  30.4 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  29.41 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  32.43 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  30.4 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  29.41 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  24.16 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  25.79 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  23.49 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  23.49 
 
 		 289 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  27.91 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  27.91 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  22.82 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  24.55 
 
 		 293 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  34 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.11 
 
 		 494 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  31.07 
 
 		 257 aa  50.1  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  31.07 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  28.97 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  22.73 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  24.16 
 
 		 413 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  20.59 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  28.24 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  23.9 
 
 		 458 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.76 
 
 		 489 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  25.45 
 
 		 258 aa  48.5  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0554  hypothetical protein  32.38 
 
 		 441 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.404034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  23.9 
 
 		 458 aa  48.5  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  31.08 
 
 		 254 aa  48.1  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  22.22 
 
 		 258 aa  48.1  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  32.18 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  28.4 
 
 		 511 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  30.28 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  19.35 
 
 		 460 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  24.04 
 
 		 456 aa  46.6  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  26.53 
 
 		 453 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  19.7 
 
 		 258 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  29.59 
 
 		 374 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  21.6 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  26.53 
 
 		 453 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  20.8 
 
 		 282 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  19.38 
 
 		 290 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  21 
 
 		 282 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  19.38 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  23.77 
 
 		 430 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  24.53 
 
 		 443 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  21.23 
 
 		 429 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  21.89 
 
 		 404 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  34.33 
 
 		 329 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  22.5 
 
 		 429 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  23.08 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  25 
 
 		 430 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  23.64 
 
 		 452 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  21.67 
 
 		 261 aa  41.6  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>