64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  98.81 
 
 		 252 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  60.71 
 
 		 254 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  58.96 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  32.76 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1716  hypothetical protein  36.72 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  34.38 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  37.4 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  33.06 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  35.14 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  32 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.76 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  32 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  30.23 
 
 		 432 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  32 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  29.24 
 
 		 434 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  32.67 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  32.67 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  32.67 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  32 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  32 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  31.25 
 
 		 469 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.22 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  33.91 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  31.71 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  37.08 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  34.19 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.74 
 
 		 429 aa  46.6  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  25 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  35.16 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  30.26 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  34.19 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.11 
 
 		 258 aa  46.2  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  34.19 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  30.92 
 
 		 426 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  30.26 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  37.08 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.07 
 
 		 456 aa  46.2  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  30.92 
 
 		 421 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  30.92 
 
 		 421 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  30.92 
 
 		 421 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  30.92 
 
 		 421 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  30.92 
 
 		 421 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  31.58 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  30.92 
 
 		 421 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  31.17 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  26.32 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  28.4 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  31.47 
 
 		 430 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  29.03 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  30.61 
 
 		 430 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  25.61 
 
 		 429 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  29.2 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  29.2 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 463 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  31.11 
 
 		 226 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  31.17 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0164  hypothetical protein  34.72 
 
 		 237 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  27.22 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  32.04 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  32.04 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  30.08 
 
 		 460 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  27.17 
 
 		 443 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  26.88 
 
 		 415 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>