78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0164 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0164  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  26.01 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  29.26 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  35.81 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  35.81 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  35.81 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  37.33 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  35.81 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  27.67 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  41.12 
 
 
260 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  35.86 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.81 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  28.82 
 
 
238 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  41.67 
 
 
260 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  41.67 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  41.67 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  29.26 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  27.88 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  27.68 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  35.94 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  37.04 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  41.07 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  39.82 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
453 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  40.19 
 
 
453 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  25.46 
 
 
293 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  34.78 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 
456 aa  52.4  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  34.78 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  23.81 
 
 
289 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  23.81 
 
 
289 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.85 
 
 
489 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.65 
 
 
463 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  31.14 
 
 
430 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  24.07 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  24.07 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  31.21 
 
 
440 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  30.82 
 
 
438 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  30.82 
 
 
438 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  28.79 
 
 
221 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  30.82 
 
 
438 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  30.82 
 
 
438 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  30.82 
 
 
438 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  30.82 
 
 
438 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 
429 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  26.35 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  30.82 
 
 
438 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0618  hypothetical protein  35.51 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433758  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0546  hypothetical protein  35.51 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0731  hypothetical protein  35.51 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.696418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  28.68 
 
 
228 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0729  hypothetical protein  35.51 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.63 
 
 
442 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2137  hypothetical protein  35.51 
 
 
221 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202208  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2039  hypothetical protein  35.51 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1687  hypothetical protein  35.51 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  40.26 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  30.19 
 
 
437 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  30.16 
 
 
228 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  27.92 
 
 
413 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34110  hypothetical protein  37.23 
 
 
252 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000196469  normal  0.0427632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  30.16 
 
 
228 aa  45.1  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  25.5 
 
 
282 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2900  hypothetical protein  37.23 
 
 
252 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0466604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  25.76 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  30.16 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  28.65 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  29.37 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  32.58 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.21 
 
 
494 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  26.72 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  22.12 
 
 
469 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  27.8 
 
 
406 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  28.23 
 
 
252 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  28.23 
 
 
252 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>