18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1786 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  467  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  56.02 
 
 
228 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  57.14 
 
 
228 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  56.02 
 
 
228 aa  246  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  55.56 
 
 
228 aa  244  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  55.56 
 
 
228 aa  242  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  40.47 
 
 
329 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  40.83 
 
 
221 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  41.63 
 
 
222 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  26.96 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  28.86 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  27 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  24.87 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  26.45 
 
 
432 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  24.18 
 
 
434 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  27.78 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  26.19 
 
 
404 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  22.09 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>