99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3258 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  446  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  43.75 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  44.6 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  44.13 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  41.63 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  43.19 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  43.66 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  43.07 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  39.86 
 
 		 329 aa  98.6  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  33.64 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  30.95 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  32.5 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  26.83 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  26.91 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  26.73 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  25.36 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  28.12 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  24.22 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  28.87 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  24.75 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  26.25 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  26.76 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  26.76 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  26.76 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  31.71 
 
 		 438 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  26.76 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  26.76 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  29.5 
 
 		 431 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  26.76 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  26.06 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  25.62 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.43 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  25.42 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.45 
 
 		 442 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  25.42 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  31.3 
 
 		 434 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  30.53 
 
 		 432 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3030  hypothetical protein  23.98 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  26.06 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  26.06 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.97 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  26.06 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  26.07 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  26.72 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  23.4 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  22.82 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3181  hypothetical protein  29.69 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  22.28 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  23.77 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  22.13 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  22.13 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0154  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  24.29 
 
 		 429 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  30.28 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  25.36 
 
 		 374 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  21.47 
 
 		 429 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  25.58 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  23.94 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  27.1 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  25.58 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  25.58 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  23.24 
 
 		 289 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  26.4 
 
 		 421 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  26.4 
 
 		 426 aa  45.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  26.4 
 
 		 421 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  22.95 
 
 		 258 aa  45.4  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  26.4 
 
 		 421 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  26.4 
 
 		 421 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  26.4 
 
 		 421 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  26.4 
 
 		 421 aa  45.4  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  24.51 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0119  hypothetical protein  32.97 
 
 		 229 aa  45.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  32.89 
 
 		 456 aa  45.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  23.24 
 
 		 289 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0130  hypothetical protein  34.48 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  25.71 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1603  hypothetical protein  34.48 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  28.47 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  29.29 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  28.25 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  25.86 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  35.05 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  27.73 
 
 		 453 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  24.79 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  28.28 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  26.26 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  24.88 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  29.63 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1824  hypothetical protein  29.13 
 
 		 308 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  21.8 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  23.97 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  22.56 
 
 		 257 aa  42  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  27.4 
 
 		 434 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 414 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  26.36 
 
 		 290 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  27.43 
 
 		 443 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>