85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0621 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  77.06 
 
 		 215 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  35.98 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  35.75 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  29.85 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  29.95 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  29.85 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  29.35 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  29.15 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  35.71 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  34.21 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  35.78 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  30.48 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  30.1 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  40 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  31.95 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  45.24 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  40.22 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  29.57 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  29.3 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  27 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3030  hypothetical protein  35.48 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  28.49 
 
 		 282 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  40.74 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  30.63 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  29.24 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  29.24 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  41.67 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  29.82 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  25.12 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  41.67 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  40.48 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  28.25 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  25.51 
 
 		 329 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  41.67 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  41.67 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  36.36 
 
 		 254 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1603  hypothetical protein  28.73 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0119  hypothetical protein  32.08 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  29.09 
 
 		 405 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0130  hypothetical protein  28.09 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  29.63 
 
 		 594 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0154  hypothetical protein  27.53 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  22.37 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  28.68 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  22.37 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  29.63 
 
 		 552 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  29.63 
 
 		 560 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0164  hypothetical protein  37.9 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  29.63 
 
 		 552 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  29.63 
 
 		 571 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  29.63 
 
 		 552 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  27.34 
 
 		 429 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  29.63 
 
 		 552 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  29.63 
 
 		 571 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  27.89 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  29.06 
 
 		 460 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  26.59 
 
 		 257 aa  45.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  25.14 
 
 		 404 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  25.29 
 
 		 404 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.07 
 
 		 489 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  28.45 
 
 		 430 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  36.96 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  29.09 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  29.58 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.93 
 
 		 463 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  26.01 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 		 453 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  29.05 
 
 		 493 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  29.58 
 
 		 291 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  32.97 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.78 
 
 		 327 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  24.03 
 
 		 252 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  24.03 
 
 		 252 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  28.97 
 
 		 469 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  31.07 
 
 		 226 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>