18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3030 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3030  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  56.33 
 
 
227 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0130  hypothetical protein  38.6 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1603  hypothetical protein  38.81 
 
 
225 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0154  hypothetical protein  37.89 
 
 
229 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0119  hypothetical protein  36.82 
 
 
229 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  34.15 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  35.48 
 
 
218 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  28.83 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  28.83 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  28.93 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  28.22 
 
 
228 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  24.31 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  27.33 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.79 
 
 
429 aa  48.5  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  26.07 
 
 
238 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  25.59 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>