16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6671 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3030  hypothetical protein  55.02 
 
 
234 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0130  hypothetical protein  37.31 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1603  hypothetical protein  36.82 
 
 
225 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0119  hypothetical protein  38.31 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0154  hypothetical protein  37.31 
 
 
229 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  28.43 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  29.13 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  29.3 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  28.03 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  24.5 
 
 
221 aa  52  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  28.03 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  26.07 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  28.03 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  28.28 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  27.45 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>