106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3647 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  34.74 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  35.98 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  29.73 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  32.29 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  31.84 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  31.84 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  31.08 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  29.9 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  32.5 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  26.96 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  35.42 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  28.79 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  26.73 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0154  hypothetical protein  31.78 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0130  hypothetical protein  31.01 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0119  hypothetical protein  30.71 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  29.13 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  26.54 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  26.54 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1603  hypothetical protein  31.67 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  25.73 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  32 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  26.07 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  32.24 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  27.01 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  31.25 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  25.6 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  25.23 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  25.23 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  24.77 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.13 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  37.21 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  26.17 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  26.17 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  26.17 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  29.12 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  24.77 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  25.79 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 404 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  37.11 
 
 		 453 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  22.71 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  37.11 
 
 		 453 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.25 
 
 		 404 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.52 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0164  hypothetical protein  42.17 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  33.57 
 
 		 438 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  25.9 
 
 		 434 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  27.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  27.18 
 
 		 440 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  27.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  27.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  27.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  27.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  27.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  27.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  30.58 
 
 		 437 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  25.9 
 
 		 434 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  25.9 
 
 		 434 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  25.9 
 
 		 434 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  39.25 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  26.49 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  25.83 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  26.06 
 
 		 458 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  26.63 
 
 		 431 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  27.54 
 
 		 458 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  27.92 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  29.75 
 
 		 460 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  28.04 
 
 		 494 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  24.38 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.24 
 
 		 489 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  24.38 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  31.19 
 
 		 433 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  28.45 
 
 		 469 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  25.91 
 
 		 405 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  35.87 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  35.87 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  28.93 
 
 		 430 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  28 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  28 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  30.65 
 
 		 460 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  27.2 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  33.05 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  33.05 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  31.19 
 
 		 434 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  33.05 
 
 		 253 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  27.21 
 
 		 426 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  27.21 
 
 		 421 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  27.21 
 
 		 421 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  27.21 
 
 		 421 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.83 
 
 		 327 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  26.73 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  32.38 
 
 		 433 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  27.21 
 
 		 421 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  32.38 
 
 		 433 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  32.38 
 
 		 433 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  27.21 
 
 		 421 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>