177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2979 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  673    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  99.47 
 
 
516 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  99.47 
 
 
514 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  99.47 
 
 
516 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  98.93 
 
 
512 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  0.00000100045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  91.49 
 
 
517 aa  345  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  79.69 
 
 
228 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  95.24 
 
 
228 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  93.88 
 
 
228 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  93.88 
 
 
228 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  71.12 
 
 
512 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  66.31 
 
 
515 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  65.24 
 
 
535 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  68.72 
 
 
228 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  58.56 
 
 
525 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  64.07 
 
 
512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  58.66 
 
 
515 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  53.44 
 
 
516 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  50 
 
 
504 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  42.35 
 
 
513 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2598  hypothetical protein  97.53 
 
 
188 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  40.47 
 
 
229 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  48.36 
 
 
492 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  47.54 
 
 
491 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  48.36 
 
 
492 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  46.72 
 
 
491 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  50 
 
 
221 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  46.72 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  47.15 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  48.67 
 
 
491 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  43.44 
 
 
508 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  45.9 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  43.44 
 
 
499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  43.44 
 
 
760 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  43.44 
 
 
508 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  43.44 
 
 
508 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  43.44 
 
 
499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  43.44 
 
 
499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  43.44 
 
 
508 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  45.53 
 
 
494 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  44.72 
 
 
492 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  47.54 
 
 
493 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  45.24 
 
 
492 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  43.65 
 
 
490 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  45.08 
 
 
492 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  43.65 
 
 
490 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  42.19 
 
 
491 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  42.19 
 
 
491 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  45.95 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  43.44 
 
 
496 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  40.98 
 
 
493 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  40.65 
 
 
496 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  42.62 
 
 
491 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  40.65 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  37.75 
 
 
482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  43.2 
 
 
492 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  40.98 
 
 
493 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  40.98 
 
 
493 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  40.98 
 
 
493 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  42.4 
 
 
492 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.6 
 
 
492 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  42.86 
 
 
482 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  43.24 
 
 
496 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  43.24 
 
 
496 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  43.24 
 
 
496 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  43.24 
 
 
496 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  43.24 
 
 
496 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  43.24 
 
 
496 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  43.24 
 
 
496 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  39.86 
 
 
222 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  40.54 
 
 
496 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  39.64 
 
 
496 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  39.64 
 
 
496 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  39.64 
 
 
496 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  39.64 
 
 
496 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.44 
 
 
496 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000326238  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  42.34 
 
 
494 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1172  putative type VI secretion protein VasRA-1  40.19 
 
 
493 aa  92.8  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  42.57 
 
 
499 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6050  hypothetical protein  37.7 
 
 
493 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  40.59 
 
 
500 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  38.52 
 
 
498 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  40.59 
 
 
500 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  34.4 
 
 
495 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  40.59 
 
 
500 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  40.59 
 
 
500 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  32.14 
 
 
500 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  33.63 
 
 
495 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1530  hypothetical protein  31.47 
 
 
491 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.704852  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  34.58 
 
 
494 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3072  hypothetical protein  32.86 
 
 
497 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  34.58 
 
 
494 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2368  hypothetical protein  30.43 
 
 
497 aa  86.3  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  34.58 
 
 
494 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50810  DUF877 family protein  33.64 
 
 
493 aa  85.9  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000021  uncharacterized protein ImpC  31.25 
 
 
497 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.147425  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3026  hypothetical protein  31.36 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00788252  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2367  hypothetical protein  32.7 
 
 
511 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0549  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  30.6 
 
 
497 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1732  hypothetical protein  37.74 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.473606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>