164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2806 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  61.68 
 
 
494 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  65.63 
 
 
496 aa  715    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  65.4 
 
 
491 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  67.15 
 
 
492 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  94.31 
 
 
492 aa  975    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  60.21 
 
 
499 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  60.08 
 
 
760 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  65.82 
 
 
491 aa  681    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  66.94 
 
 
491 aa  724    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  61.59 
 
 
492 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  65.42 
 
 
496 aa  710    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  72.53 
 
 
491 aa  786    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  72.1 
 
 
492 aa  779    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  77.89 
 
 
493 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  66.32 
 
 
491 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  75.15 
 
 
493 aa  823    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  60.21 
 
 
508 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  60.21 
 
 
508 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  77.89 
 
 
493 aa  835    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  75.98 
 
 
491 aa  822    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  71.26 
 
 
490 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  60.21 
 
 
499 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  71.26 
 
 
490 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  60.21 
 
 
499 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  100 
 
 
492 aa  1021    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  60.21 
 
 
508 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  94.72 
 
 
492 aa  964    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  65.04 
 
 
492 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  77 
 
 
492 aa  814    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  65.84 
 
 
496 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  74.07 
 
 
493 aa  793    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  67.29 
 
 
491 aa  721    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  65.5 
 
 
491 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  77.89 
 
 
493 aa  835    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  66.67 
 
 
491 aa  716    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  72.53 
 
 
491 aa  786    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  58.65 
 
 
482 aa  632  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  59.83 
 
 
508 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  53.67 
 
 
482 aa  541  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  45.13 
 
 
525 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  45.35 
 
 
515 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  43.22 
 
 
513 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  42.57 
 
 
515 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  43.17 
 
 
514 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  42.73 
 
 
516 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  42.95 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  42.73 
 
 
516 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  40.74 
 
 
516 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  42.73 
 
 
512 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  0.00000100045 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  42.13 
 
 
535 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  42.74 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  41.24 
 
 
512 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  40.96 
 
 
512 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  40.75 
 
 
498 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  41.68 
 
 
499 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  41.34 
 
 
496 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  40.37 
 
 
496 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  39.96 
 
 
496 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  41.68 
 
 
500 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  39.92 
 
 
496 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.25 
 
 
496 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000326238  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  40.57 
 
 
496 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  40.12 
 
 
496 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  39.96 
 
 
496 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  40.16 
 
 
496 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  39.96 
 
 
496 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  41.98 
 
 
500 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  40.37 
 
 
496 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  40.37 
 
 
496 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  40.16 
 
 
496 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  41.77 
 
 
500 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  39.08 
 
 
494 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  40.12 
 
 
497 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  39.27 
 
 
498 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  41.77 
 
 
500 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  41.76 
 
 
500 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.63 
 
 
497 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  42.09 
 
 
499 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  41.76 
 
 
500 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  41.76 
 
 
500 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  42 
 
 
497 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  40.63 
 
 
500 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  42.46 
 
 
499 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  39.74 
 
 
499 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  41.07 
 
 
494 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  41.76 
 
 
497 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  42.23 
 
 
499 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  38.59 
 
 
497 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  42.46 
 
 
499 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  42.46 
 
 
499 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  39.96 
 
 
502 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  39.87 
 
 
500 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  41.63 
 
 
501 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  40.82 
 
 
494 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0242  hypothetical protein  38.23 
 
 
499 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  39.96 
 
 
498 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000002005 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  42.09 
 
 
502 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2444  hypothetical protein  41.4 
 
 
504 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0922  hypothetical protein  38.03 
 
 
499 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1601  hypothetical protein  42.09 
 
 
502 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>