164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1182 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  59.07 
 
 
492 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  60.76 
 
 
491 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  100 
 
 
482 aa  998    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  59.34 
 
 
493 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  58.86 
 
 
492 aa  634    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  59.41 
 
 
491 aa  639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  59.83 
 
 
493 aa  636    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  58.65 
 
 
492 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  58.92 
 
 
492 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  59.2 
 
 
492 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  58.99 
 
 
491 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  59.13 
 
 
493 aa  625  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  59.13 
 
 
493 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  59.13 
 
 
493 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  57.59 
 
 
492 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  58.44 
 
 
491 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  57.59 
 
 
491 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  57.59 
 
 
491 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  56.72 
 
 
492 aa  616  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  55.39 
 
 
496 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  56.96 
 
 
492 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  56.54 
 
 
496 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  55.91 
 
 
491 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  57.17 
 
 
491 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  55.6 
 
 
496 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  57.17 
 
 
491 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  57.38 
 
 
494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  55.39 
 
 
760 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  56.24 
 
 
508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  55.39 
 
 
499 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  55.39 
 
 
508 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  55.39 
 
 
508 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  55.39 
 
 
499 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  55.39 
 
 
499 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  55.39 
 
 
508 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  56.87 
 
 
490 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  57.08 
 
 
490 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  56.12 
 
 
491 aa  588  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  48.1 
 
 
482 aa  502  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  42.29 
 
 
525 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  42.26 
 
 
513 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  40.64 
 
 
515 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  42.29 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  41.41 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  41.19 
 
 
514 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  41.19 
 
 
512 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  0.00000100045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  40.93 
 
 
512 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  44.14 
 
 
504 aa  392  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  40.21 
 
 
535 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  40.97 
 
 
516 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  40.97 
 
 
516 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  39.96 
 
 
498 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  39.57 
 
 
512 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  39.26 
 
 
496 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  39.43 
 
 
516 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  38.66 
 
 
496 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  38.51 
 
 
496 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  39.05 
 
 
496 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  39.05 
 
 
496 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  39.05 
 
 
496 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  39.05 
 
 
496 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  39.05 
 
 
496 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  38.51 
 
 
496 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  38.51 
 
 
496 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  37.11 
 
 
494 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  39.33 
 
 
496 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  38.22 
 
 
496 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  39.04 
 
 
496 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000326238  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.63 
 
 
495 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  37.82 
 
 
499 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  38.9 
 
 
500 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  38.9 
 
 
500 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  38.69 
 
 
500 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.03 
 
 
495 aa  359  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  38.03 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  38.03 
 
 
500 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.91 
 
 
499 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  38.27 
 
 
497 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  38.48 
 
 
497 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  39.3 
 
 
499 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  39.3 
 
 
499 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  39.3 
 
 
499 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  39.3 
 
 
499 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  36.82 
 
 
497 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.21 
 
 
497 aa  350  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  37.55 
 
 
501 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  37.47 
 
 
498 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000002005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.95 
 
 
502 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  38.27 
 
 
494 aa  346  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3564  EvpB family type VI secretion protein  36.19 
 
 
503 aa  346  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0762  hypothetical protein  36.19 
 
 
500 aa  346  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.277703  normal  0.125026 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3435  hypothetical protein  36.19 
 
 
500 aa  346  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  36.79 
 
 
500 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  37.99 
 
 
500 aa  345  8.999999999999999e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  37.99 
 
 
500 aa  345  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  37.99 
 
 
500 aa  345  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  37 
 
 
499 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50810  DUF877 family protein  38.27 
 
 
493 aa  343  5.999999999999999e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  37.84 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  39.35 
 
 
497 aa  340  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>