164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2367 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2367  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1062    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000022  uncharacterized protein ImpD  48.19 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1531  hypothetical protein  47.06 
 
 		 517 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  40.16 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3026  hypothetical protein  37.42 
 
 		 494 aa  346  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00788252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  42.26 
 
 		 496 aa  346  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  42.3 
 
 		 498 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  41.11 
 
 		 494 aa  345  8.999999999999999e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000122545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  39.8 
 
 		 500 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6050  hypothetical protein  36.95 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6049  hypothetical protein  38.85 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1530  hypothetical protein  38.76 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.704852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  40.37 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  42.03 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  42.03 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000570497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  42.03 
 
 		 496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  42.03 
 
 		 496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  42.03 
 
 		 496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000282714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  42.03 
 
 		 496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  40.16 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.34 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000326238  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  40.16 
 
 		 500 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  39.86 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  41.57 
 
 		 496 aa  334  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  40.16 
 
 		 500 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  39.68 
 
 		 495 aa  329  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  40.88 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  40.88 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  40.88 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  40.88 
 
 		 496 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3072  hypothetical protein  37.84 
 
 		 497 aa  327  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000021  uncharacterized protein ImpC  38.15 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.147425  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  39.5 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  39.5 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  39.5 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  39.5 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2368  hypothetical protein  36.53 
 
 		 497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  38.64 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  38.13 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  38.36 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  38.36 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  38.36 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  38.36 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  38.13 
 
 		 497 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3027  EvpB family type VI secretion protein  39.95 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.53 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  35.34 
 
 		 515 aa  303  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0333  hypothetical protein  37.9 
 
 		 499 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0242  hypothetical protein  37.9 
 
 		 499 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1694  hypothetical protein  37.67 
 
 		 530 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1910  hypothetical protein  37.67 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  34.69 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0922  hypothetical protein  37.67 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1209  hypothetical protein  37.67 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2184  hypothetical protein  37.67 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6674  EvpB family type VI secretion protein  39.04 
 
 		 499 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585519  normal  0.849864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  34.31 
 
 		 516 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  36.84 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  37.95 
 
 		 498 aa  299  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000002005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  35.33 
 
 		 517 aa  299  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3564  EvpB family type VI secretion protein  37.3 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0762  hypothetical protein  37.3 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.277703  normal  0.125026 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3435  hypothetical protein  37.3 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333697  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3475  hypothetical protein  38.41 
 
 		 497 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  35.33 
 
 		 535 aa  297  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  36.61 
 
 		 501 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  33.81 
 
 		 514 aa  296  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  34.62 
 
 		 512 aa  296  6e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  0.00000100045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3027  hypothetical protein  37.13 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0329935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  33.81 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  33.81 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  36.45 
 
 		 497 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  36.61 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  36.38 
 
 		 498 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  36.38 
 
 		 500 aa  293  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0940  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  37.44 
 
 		 499 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  39.17 
 
 		 494 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  36.59 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  35.62 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1732  hypothetical protein  36.57 
 
 		 500 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.473606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  35.62 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  35.62 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  35.62 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  35.62 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  35.62 
 
 		 508 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  35.62 
 
 		 760 aa  290  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0404  hypothetical protein  36.34 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1199  hypothetical protein  36.34 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  39.4 
 
 		 494 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1601  hypothetical protein  36.34 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  36.34 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2959  hypothetical protein  36.34 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2834  hypothetical protein  36.34 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0454  hypothetical protein  36.34 
 
 		 502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  34.56 
 
 		 515 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  36.34 
 
 		 502 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  38.94 
 
 		 494 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0297  SciI protein  38.64 
 
 		 502 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.770201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  33.62 
 
 		 512 aa  286  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0306  type VI secretion protein, EvpB/family  38.64 
 
 		 502 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>