63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0173 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  99.12 
 
 
228 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  97.81 
 
 
228 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  97.81 
 
 
228 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  87.91 
 
 
228 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  79.69 
 
 
329 aa  296  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  56.02 
 
 
229 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  50.46 
 
 
221 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  44.6 
 
 
222 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  33.65 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  29.95 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  32.29 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  27.54 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0154  hypothetical protein  30.77 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  30.4 
 
 
215 aa  55.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  27.27 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0130  hypothetical protein  30.07 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  27.01 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  27.19 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.44 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1603  hypothetical protein  30.07 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  26.97 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3030  hypothetical protein  28.83 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  26.97 
 
 
273 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  24.59 
 
 
255 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  24.59 
 
 
255 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.97 
 
 
258 aa  52  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  28.03 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  24.57 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  26.38 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  26.84 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  26.4 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  26.4 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.92 
 
 
489 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0119  hypothetical protein  27.21 
 
 
229 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.74 
 
 
258 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  24.03 
 
 
253 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  24.03 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  29 
 
 
429 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  24.82 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  26.5 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  24.43 
 
 
262 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  31.14 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  28.7 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.72 
 
 
260 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  28.44 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  28.29 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  23.46 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  23.53 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  27.61 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  21.05 
 
 
254 aa  42.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  24.8 
 
 
290 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  22.43 
 
 
282 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  24.8 
 
 
282 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  29.89 
 
 
434 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  25.19 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  25.19 
 
 
261 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  25.52 
 
 
293 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  27.27 
 
 
261 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  27.37 
 
 
226 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.08 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  22.9 
 
 
282 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>