59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2508 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  98.25 
 
 		 228 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  98.68 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  97.81 
 
 		 228 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  86.98 
 
 		 228 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  93.88 
 
 		 329 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  55.56 
 
 		 229 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  49.54 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  43.66 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  32.85 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  29.35 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  31.08 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0154  hypothetical protein  28.84 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1603  hypothetical protein  28.84 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  26.78 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0130  hypothetical protein  28.37 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  30.4 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3030  hypothetical protein  28.93 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  26.97 
 
 		 263 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  26.87 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  26.86 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  26.23 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  26.23 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  24.57 
 
 		 257 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  26.4 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.77 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.92 
 
 		 489 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0119  hypothetical protein  26.47 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  26.84 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  25.79 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  27.45 
 
 		 227 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  25.41 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  26.4 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  26.4 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  29 
 
 		 429 aa  48.5  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  24.03 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  24.82 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  24.03 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  28.06 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  24.23 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  26.72 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  28.7 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  31.14 
 
 		 254 aa  45.1  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  22.64 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  24.8 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  22.88 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  27.61 
 
 		 260 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  26.97 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  21.94 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  23.46 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  21.43 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  25.19 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  25.19 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  27.27 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  26.18 
 
 		 493 aa  42.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  27.27 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  21.05 
 
 		 282 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1179  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit B (Asp/Glu-ADT subunit B)  21.05 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>