14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0554 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  885    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.404034  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3843  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 708 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0921  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 685 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0466  Serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3993  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 711 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  27.87 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  31.4 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  27.75 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.23 
 
 		 219 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  32.38 
 
 		 215 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  31.43 
 
 		 226 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  30.48 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  30.77 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  30.71 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>