More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1805 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  63.33 
 
 		 558 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  100 
 
 		 559 aa  1109    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  80.5 
 
 		 559 aa  864    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  79.61 
 
 		 559 aa  851    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.56 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  31.68 
 
 		 560 aa  309  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 		 561 aa  300  6e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  34.33 
 
 		 561 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  33.8 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  32.33 
 
 		 568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  27.76 
 
 		 582 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  28.37 
 
 		 581 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.51 
 
 		 565 aa  231  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  27.57 
 
 		 575 aa  229  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  26.03 
 
 		 586 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  26.67 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  26.88 
 
 		 586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  26.72 
 
 		 595 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.18 
 
 		 551 aa  210  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  26.16 
 
 		 558 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  27.09 
 
 		 556 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  27.09 
 
 		 608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  27.38 
 
 		 586 aa  201  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  26.98 
 
 		 592 aa  198  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  26.82 
 
 		 557 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  25.41 
 
 		 554 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  29.14 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.17 
 
 		 567 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  28.83 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  27.55 
 
 		 566 aa  194  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  27.04 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  25.17 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  27.67 
 
 		 565 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  28.37 
 
 		 552 aa  187  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  26.33 
 
 		 577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  26.2 
 
 		 555 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  26.57 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  27.4 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  25.13 
 
 		 572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  28.01 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  24.25 
 
 		 605 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  25.52 
 
 		 554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  26.81 
 
 		 561 aa  184  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  28.32 
 
 		 553 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  27.62 
 
 		 562 aa  184  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  27.48 
 
 		 570 aa  183  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  28.37 
 
 		 552 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  26.17 
 
 		 558 aa  183  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  25.43 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  26 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  24.6 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  24.4 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  26.2 
 
 		 557 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  27.29 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  27.44 
 
 		 553 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  27.92 
 
 		 552 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  27.4 
 
 		 552 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  25.3 
 
 		 551 aa  180  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  27.4 
 
 		 552 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  27.4 
 
 		 552 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  27.4 
 
 		 552 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  28.9 
 
 		 550 aa  180  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  26.54 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  29.98 
 
 		 555 aa  177  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  26.11 
 
 		 554 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 574 aa  176  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  25.04 
 
 		 559 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  27.79 
 
 		 580 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  26.85 
 
 		 557 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  23.59 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  27.49 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  25.82 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  25.04 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  25.93 
 
 		 572 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  28.22 
 
 		 552 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  25.63 
 
 		 554 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  26.67 
 
 		 560 aa  173  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  27.21 
 
 		 552 aa  173  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  24.47 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  26.16 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  24.55 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  24.55 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  27.75 
 
 		 553 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  24.55 
 
 		 549 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  25.45 
 
 		 559 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  28.45 
 
 		 559 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  26.64 
 
 		 568 aa  172  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  24.51 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  28.34 
 
 		 553 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  26.06 
 
 		 557 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  25.88 
 
 		 557 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  25.81 
 
 		 579 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  25.95 
 
 		 560 aa  170  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  27.6 
 
 		 553 aa  170  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  24.05 
 
 		 559 aa  170  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  24.56 
 
 		 573 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  24.27 
 
 		 553 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  24.19 
 
 		 549 aa  170  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  25.82 
 
 		 552 aa  170  8e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  24.37 
 
 		 549 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>