More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_19221 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  80.5 
 
 		 559 aa  860    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  100 
 
 		 559 aa  1107    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  92.84 
 
 		 559 aa  998    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  61.54 
 
 		 558 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  31.98 
 
 		 562 aa  299  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  31.73 
 
 		 560 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 		 561 aa  290  6e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  33.57 
 
 		 568 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  33.04 
 
 		 561 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.87 
 
 		 561 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  27.87 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  31.91 
 
 		 565 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  28.8 
 
 		 575 aa  235  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  27.29 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  27.24 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  28.45 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  28.45 
 
 		 586 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  28.97 
 
 		 566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  28.06 
 
 		 551 aa  210  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  27.56 
 
 		 586 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  26.61 
 
 		 592 aa  203  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  27.37 
 
 		 557 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  27.09 
 
 		 557 aa  200  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  27.37 
 
 		 557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  26.33 
 
 		 557 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  26.74 
 
 		 558 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  26.75 
 
 		 555 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  26.98 
 
 		 556 aa  195  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  28.3 
 
 		 561 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  26.52 
 
 		 557 aa  194  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  27.34 
 
 		 562 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  26.54 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  26.26 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.31 
 
 		 567 aa  191  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  25.95 
 
 		 586 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  27.14 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  27.79 
 
 		 568 aa  188  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  28.3 
 
 		 552 aa  187  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  27.21 
 
 		 565 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  27.26 
 
 		 570 aa  186  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  25.95 
 
 		 561 aa  186  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  30.82 
 
 		 550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  27.08 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  25.87 
 
 		 554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  26.58 
 
 		 572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  28.12 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  27.19 
 
 		 560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  26.53 
 
 		 554 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  27.74 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  28.12 
 
 		 552 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  26.54 
 
 		 579 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 555 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  27.69 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  27.85 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  26.87 
 
 		 577 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  28.04 
 
 		 552 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  26.26 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  27.57 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  26.37 
 
 		 579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  26.54 
 
 		 579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  27.57 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  27.57 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  27.57 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  27.72 
 
 		 555 aa  180  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  26.28 
 
 		 564 aa  180  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  26.58 
 
 		 549 aa  180  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  24.91 
 
 		 559 aa  180  5.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  26.2 
 
 		 583 aa  180  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  28.37 
 
 		 557 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  27.94 
 
 		 553 aa  179  8e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  27.5 
 
 		 574 aa  179  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  23.91 
 
 		 605 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  27.23 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  24.82 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  26.37 
 
 		 579 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  26.2 
 
 		 583 aa  179  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  26.79 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  25.5 
 
 		 559 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  26.2 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  25.85 
 
 		 556 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  25.85 
 
 		 608 aa  178  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  26.2 
 
 		 579 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  28.77 
 
 		 574 aa  177  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  26.2 
 
 		 579 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  25.5 
 
 		 559 aa  177  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  26.69 
 
 		 553 aa  177  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  26.88 
 
 		 569 aa  177  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  25.44 
 
 		 551 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  26.02 
 
 		 562 aa  176  7e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  25.27 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  29.58 
 
 		 559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  29.58 
 
 		 559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  28.24 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  28.62 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  28.85 
 
 		 559 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  27.26 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  26.78 
 
 		 580 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0777  SMC domain-containing protein  27.45 
 
 		 539 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397479  normal  0.58729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  26.53 
 
 		 558 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1453  DNA repair protein RecN  24.11 
 
 		 557 aa  174  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0975706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>