More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_18511 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  100 
 
 
568 aa  1146    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  50.18 
 
 
562 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  47.6 
 
 
560 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  47.25 
 
 
561 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  41.64 
 
 
561 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  41.81 
 
 
561 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  38.6 
 
 
575 aa  356  7.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  37.85 
 
 
582 aa  352  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 
581 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  36.63 
 
 
595 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 
586 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 
586 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 
592 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 
586 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  33.57 
 
 
559 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.33 
 
 
559 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.51 
 
 
559 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  30.76 
 
 
558 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.61 
 
 
565 aa  242  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.68 
 
 
555 aa  242  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  29.7 
 
 
555 aa  238  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  30.67 
 
 
559 aa  237  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  29.51 
 
 
573 aa  229  7e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  29.81 
 
 
554 aa  229  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  31.5 
 
 
586 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.39 
 
 
608 aa  228  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.45 
 
 
556 aa  226  6e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  32.26 
 
 
565 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  29.89 
 
 
560 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  28.6 
 
 
583 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  28.22 
 
 
583 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  28.47 
 
 
579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  27.92 
 
 
579 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  27.92 
 
 
579 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  28.09 
 
 
579 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 
579 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  28.29 
 
 
579 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  28.29 
 
 
579 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  30.72 
 
 
572 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  29.66 
 
 
577 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  27.76 
 
 
579 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  30.45 
 
 
566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  28.16 
 
 
573 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  28.27 
 
 
579 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  29.84 
 
 
557 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  31.12 
 
 
561 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.24 
 
 
580 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  29.05 
 
 
562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  28.01 
 
 
605 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  27.79 
 
 
562 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  30.39 
 
 
567 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  30.2 
 
 
601 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  30.6 
 
 
552 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  29.11 
 
 
556 aa  210  7e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  30.93 
 
 
558 aa  207  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  28.55 
 
 
554 aa  207  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  29.49 
 
 
557 aa  207  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  28.42 
 
 
558 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  28.55 
 
 
554 aa  206  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  30.65 
 
 
556 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  30.41 
 
 
588 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.76 
 
 
567 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  29.81 
 
 
569 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  30.22 
 
 
588 aa  204  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  29.19 
 
 
574 aa  203  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  28.96 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  28.86 
 
 
572 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  28.24 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  29.73 
 
 
599 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  30.07 
 
 
588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  28.75 
 
 
570 aa  200  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  29.53 
 
 
551 aa  200  7e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0611  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 
558 aa  199  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0450  DNA repair protein RecN  31.71 
 
 
558 aa  199  9e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  29.8 
 
 
587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  29.49 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  28.4 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1325  DNA repair protein RecN  29.26 
 
 
529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11608  normal  0.581272 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  30.03 
 
 
574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  28.4 
 
 
554 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  28.13 
 
 
565 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  29.67 
 
 
562 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  31.51 
 
 
552 aa  197  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  30.11 
 
 
559 aa  196  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  27.69 
 
 
557 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  31.04 
 
 
551 aa  196  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  30.13 
 
 
549 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  29.56 
 
 
549 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  29.21 
 
 
553 aa  196  9e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  29.56 
 
 
549 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  28.13 
 
 
565 aa  196  9e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  29.56 
 
 
549 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  29.04 
 
 
549 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  29.38 
 
 
555 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  29.2 
 
 
552 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  29.3 
 
 
592 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.790366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  27.72 
 
 
568 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  29.44 
 
 
576 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  28.98 
 
 
549 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  29.66 
 
 
557 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.724371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>