More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2318 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 561 aa  1105    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  71.48 
 
 		 560 aa  727    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  61.81 
 
 		 562 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  47.25 
 
 		 568 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  40.39 
 
 		 561 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  40.64 
 
 		 561 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  44.42 
 
 		 581 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  40.41 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  39.05 
 
 		 575 aa  368  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  42.54 
 
 		 595 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  38.18 
 
 		 586 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  38.36 
 
 		 586 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  38.57 
 
 		 592 aa  333  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  34.16 
 
 		 559 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  38.1 
 
 		 586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.62 
 
 		 559 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.26 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.2 
 
 		 558 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  31.49 
 
 		 566 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 559 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 555 aa  243  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  30.69 
 
 		 567 aa  240  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.91 
 
 		 565 aa  236  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 586 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 		 601 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  34.49 
 
 		 557 aa  230  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  30.58 
 
 		 562 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  33.82 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 		 560 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.76 
 
 		 574 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  29.61 
 
 		 557 aa  226  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  34.67 
 
 		 559 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  28.57 
 
 		 555 aa  226  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  31.7 
 
 		 550 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  34 
 
 		 549 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 		 554 aa  224  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 549 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  33.64 
 
 		 549 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 554 aa  223  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  32.87 
 
 		 559 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0450  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31.56 
 
 		 565 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0611  DNA repair protein RecN  35.43 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  28.83 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  33.15 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 549 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  28.74 
 
 		 551 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  31.73 
 
 		 554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  32.61 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  33.7 
 
 		 591 aa  220  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  31.48 
 
 		 572 aa  220  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  32.36 
 
 		 599 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  32.67 
 
 		 563 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  28.97 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  27.8 
 
 		 552 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  28.6 
 
 		 565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  28.67 
 
 		 573 aa  217  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  30.31 
 
 		 561 aa  217  5.9999999999999996e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  36.19 
 
 		 564 aa  216  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  28.26 
 
 		 542 aa  216  9e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  31.38 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  34.97 
 
 		 558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 557 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  29.34 
 
 		 570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  32.52 
 
 		 567 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  31.21 
 
 		 578 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  29.73 
 
 		 573 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 589 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 		 549 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  30.37 
 
 		 608 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  33.85 
 
 		 553 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  30.37 
 
 		 556 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.54 
 
 		 574 aa  211  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  30.77 
 
 		 572 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  28.75 
 
 		 556 aa  210  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  30.83 
 
 		 580 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  32.18 
 
 		 605 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  30.19 
 
 		 555 aa  210  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.17 
 
 		 554 aa  210  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  35.31 
 
 		 567 aa  210  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  33.68 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  33.68 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  33.68 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  33.68 
 
 		 553 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  31.84 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  33.56 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  35.24 
 
 		 551 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  29.91 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  31.9 
 
 		 553 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  31.33 
 
 		 549 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>