More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1324 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  100 
 
 		 561 aa  1130    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  98.04 
 
 		 561 aa  1108    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  42.53 
 
 		 562 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  41.46 
 
 		 560 aa  438  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  41.64 
 
 		 568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  40.32 
 
 		 561 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 582 aa  310  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 575 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 		 586 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 586 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  32.24 
 
 		 595 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  35.27 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 		 592 aa  283  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  33.8 
 
 		 559 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  33.04 
 
 		 559 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.16 
 
 		 559 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.74 
 
 		 558 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  29.75 
 
 		 560 aa  233  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  30.12 
 
 		 586 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  28.62 
 
 		 568 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  28.39 
 
 		 569 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  28.44 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  28.44 
 
 		 549 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  28.44 
 
 		 549 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  27.89 
 
 		 549 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  27.89 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  28.07 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  28.07 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  28.07 
 
 		 549 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  30.62 
 
 		 553 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  30.94 
 
 		 557 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  30.84 
 
 		 565 aa  220  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  30.64 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  28.7 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  29.29 
 
 		 574 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  28.01 
 
 		 559 aa  219  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  28.04 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  28.4 
 
 		 578 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  28.13 
 
 		 554 aa  217  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  27.52 
 
 		 549 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  32.69 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  28.8 
 
 		 601 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1726  DNA repair protein RecN  27.97 
 
 		 551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.995264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  31.1 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  28.55 
 
 		 573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  28.02 
 
 		 547 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  26.68 
 
 		 554 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  27.98 
 
 		 558 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  29.8 
 
 		 555 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  30.89 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  29.2 
 
 		 559 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  28.49 
 
 		 589 aa  212  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  29.56 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  30.24 
 
 		 562 aa  210  6e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  28.4 
 
 		 587 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.28 
 
 		 551 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  27.5 
 
 		 557 aa  208  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  29.38 
 
 		 565 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  28.89 
 
 		 572 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2505  DNA repair protein RecN  29.33 
 
 		 555 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  27.87 
 
 		 573 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  30.74 
 
 		 555 aa  205  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  28.77 
 
 		 570 aa  204  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  27.47 
 
 		 579 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  28.13 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  32.13 
 
 		 569 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  28.92 
 
 		 553 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  28.19 
 
 		 559 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  28.42 
 
 		 555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1303  DNA repair protein RecN  28.62 
 
 		 557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.523963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  28.85 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  28.7 
 
 		 577 aa  200  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  27.6 
 
 		 567 aa  200  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  30.09 
 
 		 553 aa  200  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  30.09 
 
 		 553 aa  199  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  30.09 
 
 		 553 aa  199  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  28.62 
 
 		 557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  28.01 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  27.56 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.46 
 
 		 567 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3968  DNA repair protein RecN  27.72 
 
 		 556 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.039947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  29.73 
 
 		 552 aa  198  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  26.58 
 
 		 556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  28.29 
 
 		 553 aa  196  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  27.64 
 
 		 562 aa  196  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  28.11 
 
 		 558 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  26.77 
 
 		 557 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  28.72 
 
 		 558 aa  196  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  26.76 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  29.79 
 
 		 550 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  29.65 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>