More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2692 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  71.48 
 
 
561 aa  721    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  100 
 
 
560 aa  1097    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  61.99 
 
 
562 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  47.6 
 
 
568 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  41.77 
 
 
561 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  41.59 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  45.17 
 
 
581 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  41.03 
 
 
582 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  41.36 
 
 
575 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  43.25 
 
 
595 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  38.61 
 
 
586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  38.18 
 
 
586 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  39.21 
 
 
592 aa  337  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  38.29 
 
 
586 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  32.51 
 
 
559 aa  316  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  33.04 
 
 
559 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  31.68 
 
 
559 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  30.85 
 
 
558 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  37.43 
 
 
558 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.1 
 
 
567 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  32.39 
 
 
557 aa  259  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  32.92 
 
 
555 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  32.57 
 
 
577 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.73 
 
 
551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.42 
 
 
566 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.53 
 
 
574 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 
554 aa  250  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 
559 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31 
 
 
565 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  31.3 
 
 
550 aa  243  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.78 
 
 
601 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  30.38 
 
 
570 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  35.93 
 
 
557 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 
549 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 
549 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 
549 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 
549 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 
549 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 
549 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  33.46 
 
 
549 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 
556 aa  238  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  33.15 
 
 
549 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  28.34 
 
 
562 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  30.11 
 
 
565 aa  237  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  31.86 
 
 
580 aa  236  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 
554 aa  236  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  33.88 
 
 
549 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  34.36 
 
 
554 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  31.46 
 
 
554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  33.88 
 
 
549 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.69 
 
 
560 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  29.72 
 
 
552 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 
549 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  34.11 
 
 
552 aa  234  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 
549 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  29.11 
 
 
565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 
549 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.2 
 
 
599 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 
559 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  29.11 
 
 
565 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 
567 aa  233  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.27 
 
 
555 aa  233  9e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  32.62 
 
 
558 aa  233  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  32.35 
 
 
578 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3602  DNA repair protein RecN  34.4 
 
 
557 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779581 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  33 
 
 
586 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  29.37 
 
 
555 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0450  DNA repair protein RecN  35.86 
 
 
558 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 
549 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0611  DNA repair protein RecN  35.86 
 
 
558 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  29.27 
 
 
579 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  32.68 
 
 
605 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  30.1 
 
 
573 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  29.39 
 
 
561 aa  226  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  34.4 
 
 
551 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  33.76 
 
 
549 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 
554 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  29.43 
 
 
579 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 
589 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 
559 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  32.08 
 
 
588 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  31.23 
 
 
555 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  32.4 
 
 
574 aa  224  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  32.22 
 
 
563 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  33.15 
 
 
569 aa  223  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  35.1 
 
 
573 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  33.09 
 
 
568 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  28.76 
 
 
579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  28.67 
 
 
552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  28.31 
 
 
579 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.73 
 
 
588 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  29.84 
 
 
573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  34.15 
 
 
572 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  28.76 
 
 
579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  30.16 
 
 
556 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  28.76 
 
 
579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  28.76 
 
 
579 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.8 
 
 
553 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.51 
 
 
588 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  28.6 
 
 
583 aa  220  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>