More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_19041 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  63.33 
 
 		 559 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  100 
 
 		 558 aa  1095    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  60.64 
 
 		 559 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  61.54 
 
 		 559 aa  646    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  31.32 
 
 		 562 aa  303  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  32.2 
 
 		 561 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 560 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  30.76 
 
 		 568 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  33.1 
 
 		 561 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  29.7 
 
 		 581 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  30.56 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  31.27 
 
 		 575 aa  259  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  33.51 
 
 		 561 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  27.87 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  28.42 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  31.2 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  28.25 
 
 		 586 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  28.13 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  27.03 
 
 		 558 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.53 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  27.59 
 
 		 554 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  28.29 
 
 		 560 aa  200  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  26.92 
 
 		 557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  27.93 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 574 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  29.5 
 
 		 565 aa  197  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  28.19 
 
 		 555 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  29.11 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  28.34 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.46 
 
 		 567 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  26.61 
 
 		 573 aa  192  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  28.8 
 
 		 552 aa  190  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  25.78 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  25.79 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  29.42 
 
 		 555 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  25.14 
 
 		 547 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  28.06 
 
 		 588 aa  188  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  25.13 
 
 		 605 aa  188  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0907  DNA repair protein RecN  24.46 
 
 		 549 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933799  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  26.75 
 
 		 562 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  27.17 
 
 		 549 aa  187  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  27.27 
 
 		 608 aa  187  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  30.02 
 
 		 561 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  27.27 
 
 		 556 aa  186  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  27.63 
 
 		 579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  27.09 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  28.25 
 
 		 557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  31.86 
 
 		 550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  27.32 
 
 		 559 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  27.45 
 
 		 588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  26.82 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  26.37 
 
 		 564 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  26.33 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  25.36 
 
 		 556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  28.04 
 
 		 580 aa  183  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  27.59 
 
 		 567 aa  183  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  27.97 
 
 		 561 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  24.04 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  26.95 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  28.18 
 
 		 568 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  26.15 
 
 		 578 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  24.18 
 
 		 549 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  24.18 
 
 		 549 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  24.73 
 
 		 549 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  24.73 
 
 		 549 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  27.39 
 
 		 574 aa  180  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  24.73 
 
 		 549 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  26.9 
 
 		 565 aa  180  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  25.32 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  27.36 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  27.76 
 
 		 579 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  26.86 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  25.75 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  24.42 
 
 		 559 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  27.58 
 
 		 579 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  26.33 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3489  DNA repair protein RecN  26.07 
 
 		 567 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000536624 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0537  DNA repair protein RecN  26.83 
 
 		 568 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.674533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  24.55 
 
 		 549 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  24.18 
 
 		 549 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  27.58 
 
 		 579 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  27.62 
 
 		 588 aa  177  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  24.42 
 
 		 559 aa  177  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  27.58 
 
 		 579 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  29.4 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  25.87 
 
 		 558 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  27.64 
 
 		 573 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  26.95 
 
 		 562 aa  176  9e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  27.19 
 
 		 579 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  24.92 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  27.4 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  27.02 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  29.48 
 
 		 553 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  27.02 
 
 		 579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  27.02 
 
 		 579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  25.62 
 
 		 553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  24.56 
 
 		 601 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  27.44 
 
 		 555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  28.12 
 
 		 552 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  26.74 
 
 		 552 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>