More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_19031 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_19031  DNA repair protein RecN, ABC transporter  100 
 
 		 559 aa  1106    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.298461  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19221  DNA repair protein RecN, ABC transporter  92.84 
 
 		 559 aa  1006    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.589308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1805  DNA repair protein RecN, ABC transporter  79.61 
 
 		 559 aa  854    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19041  DNA repair protein RecN, ABC transporter  60.64 
 
 		 558 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0149908  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  32.21 
 
 		 560 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  32.62 
 
 		 561 aa  296  5e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  31.32 
 
 		 562 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  32.51 
 
 		 568 aa  277  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  32.16 
 
 		 561 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  31.99 
 
 		 561 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  28.01 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  32.04 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  27.8 
 
 		 575 aa  230  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  26.27 
 
 		 586 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  26.27 
 
 		 586 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 582 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 595 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  29.02 
 
 		 566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  28.85 
 
 		 551 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  26.11 
 
 		 592 aa  203  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  27.23 
 
 		 586 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  26.77 
 
 		 556 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  27.07 
 
 		 555 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  27.46 
 
 		 557 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  29.46 
 
 		 567 aa  196  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  26.71 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  28.47 
 
 		 561 aa  194  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  27.87 
 
 		 562 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  26.81 
 
 		 586 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  27.34 
 
 		 558 aa  191  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  26.52 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  26.55 
 
 		 557 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  27.44 
 
 		 570 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  26.89 
 
 		 557 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  26.42 
 
 		 557 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  26.28 
 
 		 561 aa  184  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  25.52 
 
 		 554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  25.93 
 
 		 573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  28.29 
 
 		 552 aa  183  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  27 
 
 		 557 aa  183  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  27.79 
 
 		 568 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  28.57 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  26.33 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  28.11 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  27.78 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  28.13 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  25.74 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  27.18 
 
 		 565 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  27.32 
 
 		 577 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  25.89 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  27.78 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  27.78 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  27.78 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  28.11 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  27.78 
 
 		 552 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  26.53 
 
 		 552 aa  180  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  29.21 
 
 		 567 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6893  DNA repair protein RecN  26.53 
 
 		 549 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23585  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  27.96 
 
 		 553 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  25.31 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  26.9 
 
 		 560 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  26.24 
 
 		 579 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  23.22 
 
 		 605 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  27.07 
 
 		 558 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  26.3 
 
 		 579 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  26.57 
 
 		 580 aa  176  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  28.37 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  26.41 
 
 		 579 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  26.24 
 
 		 579 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  26.36 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1139  DNA repair protein RecN  30.38 
 
 		 555 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  27 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  26.24 
 
 		 583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  26.41 
 
 		 579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  25.17 
 
 		 608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  27.57 
 
 		 555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  25.62 
 
 		 556 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  26.24 
 
 		 583 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  25.13 
 
 		 560 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  25.17 
 
 		 556 aa  174  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  24.78 
 
 		 565 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  25.48 
 
 		 559 aa  173  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  25.48 
 
 		 559 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  26.24 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  26.24 
 
 		 579 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  27.9 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  26.24 
 
 		 579 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  24.95 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  26.44 
 
 		 555 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  24.34 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3465  DNA repair protein RecN  30.59 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.393637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  25.62 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  24.72 
 
 		 572 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  26.88 
 
 		 553 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  26.71 
 
 		 569 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  25.09 
 
 		 557 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  28.93 
 
 		 554 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  29.03 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  27.7 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  24.73 
 
 		 557 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>