81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47790 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  100 
 
 
169 aa  347  3e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  64.85 
 
 
169 aa  234  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  63.76 
 
 
153 aa  213  8e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  63.76 
 
 
149 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08258  ubiquitin conjugating enzyme (UbcH), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04060)  40.49 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  42.45 
 
 
147 aa  130  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  43.38 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  36.08 
 
 
167 aa  127  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  41.43 
 
 
149 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  41.21 
 
 
165 aa  124  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  39.42 
 
 
147 aa  124  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  39.57 
 
 
147 aa  122  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27762  predicted protein  42.07 
 
 
160 aa  122  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.613975  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  40.3 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  47.97 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  36.81 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03030  ubiquitin conjugating enzyme, putative  38.51 
 
 
175 aa  117  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0295747  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  41.1 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  36.71 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  38.69 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05351  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  37.95 
 
 
168 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02210  ubiquitin-conjugating enzyme e2-18 kda, putative  38 
 
 
158 aa  112  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  37.6 
 
 
134 aa  110  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  40.46 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  35.04 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  37.96 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  32.21 
 
 
192 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  38.26 
 
 
158 aa  104  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00226  ubiquitin conjugating enzyme (UbcC), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09200)  37.34 
 
 
225 aa  103  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.491024  normal  0.950814 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  37.68 
 
 
220 aa  100  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  32.12 
 
 
152 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84844  predicted protein  34.36 
 
 
242 aa  99.8  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31651  predicted protein  37.04 
 
 
190 aa  98.6  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386073  normal  0.188387 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  32.58 
 
 
197 aa  95.9  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  39.23 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  36.2 
 
 
209 aa  95.9  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0194964  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02120  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  95.9  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33350  predicted protein  36.18 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.386657  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04010  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 
246 aa  95.5  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  32.12 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01761  ubiquitin conjugating enzyme Ubc8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09160)  37.01 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  33.83 
 
 
220 aa  93.6  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40340  predicted protein  33.73 
 
 
174 aa  92  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  34.13 
 
 
135 aa  92  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00500  hypothetical protein  36.15 
 
 
234 aa  90.9  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57900  predicted protein  32.43 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309908  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01020  E2 ubiquitin-conjugating enzyme, putative  30.32 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.105577  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10324  NEDD8 conjugating enzyme (UbcL), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14430)  28.37 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315281  normal  0.17789 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_5608  predicted protein  32.62 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10365  ubiquitin conjugating enzyme (UbcB), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12850)  29.71 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121391  normal  0.667928 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02212  ubiquitin conjugating enzyme (UbcA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07040)  32.88 
 
 
246 aa  82  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0396223 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35186  predicted protein  35.9 
 
 
245 aa  81.6  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40298  predicted protein  26.8 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.297214  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01159  ubiquitin conjugating enzyme E2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11410)  30.77 
 
 
470 aa  78.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30092  predicted protein  32.48 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0588671  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48810  predicted protein  27.21 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183416  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  36.21 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07577  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15040)  30.95 
 
 
449 aa  72.8  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116566  normal  0.884772 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10874  ubiquitin-conjugating enzyme Ubc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04612)  29.75 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12468  predicted protein  28.83 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.665817  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02130  ubiquitin-conjugating enzyme E2-28.4KD, putative  30 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48883  predicted protein  34.13 
 
 
414 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34709  Ubiquitin-conjugating enzyme variant MMS2 (UEV MMS2)  27.61 
 
 
137 aa  57.8  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37077  predicted protein  32.52 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36882  predicted protein  23.94 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05830  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 
927 aa  54.3  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00168148  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00870  conserved hypothetical protein  25.19 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01270  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 
920 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56437  predicted protein  26.76 
 
 
355 aa  52.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03136  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13060)  26.19 
 
 
1070 aa  52  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.460708  normal  0.136917 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07338  ubiquitin conjugating enzyme (UbcF), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16470)  23.73 
 
 
334 aa  50.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0200334  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02413  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13690)  29.36 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216449 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00883  ubiquitin-conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15570)  30.26 
 
 
305 aa  48.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.18822  normal  0.509658 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03644  protein involved in error-free postreplication DNA repair (Eurofung)  24 
 
 
141 aa  47.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291952 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48512  predicted protein  30.95 
 
 
517 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10549  predicted protein  22.58 
 
 
111 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000151978  normal  0.856804 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02640  expressed protein  24.43 
 
 
242 aa  44.7  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29356  predicted protein  24.39 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04250  hypothetical protein  43.24 
 
 
139 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34833  predicted protein  21.14 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.169117 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05344  hypothetical protein similar to UVSJ (Eurofung)  33.33 
 
 
247 aa  40.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.017357  normal  0.102351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>