60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40298 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_40298  predicted protein  100 
 
 
194 aa  393  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.297214  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01020  E2 ubiquitin-conjugating enzyme, putative  61.15 
 
 
177 aa  213  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.105577  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10324  NEDD8 conjugating enzyme (UbcL), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14430)  60.53 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315281  normal  0.17789 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12468  predicted protein  46.84 
 
 
185 aa  188  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.665817  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48810  predicted protein  48.41 
 
 
220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183416  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  35.71 
 
 
147 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  35 
 
 
147 aa  99  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  35.56 
 
 
147 aa  97.8  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  34.33 
 
 
149 aa  96.7  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  33.14 
 
 
181 aa  95.5  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  30.37 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  34.81 
 
 
150 aa  92.8  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  40.4 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  92.4  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  31.94 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  29.14 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  34.62 
 
 
147 aa  89.4  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  36.23 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  33.58 
 
 
159 aa  89  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57900  predicted protein  35.71 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309908  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  40.43 
 
 
152 aa  88.6  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  30.14 
 
 
149 aa  88.2  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27762  predicted protein  35.29 
 
 
160 aa  88.2  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.613975  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02120  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 
260 aa  88.2  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  41.67 
 
 
220 aa  87  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  36.96 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  27.52 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  27.4 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  32.35 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00500  hypothetical protein  38.83 
 
 
234 aa  79  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01761  ubiquitin conjugating enzyme Ubc8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09160)  35.64 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  34.48 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  38.61 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40340  predicted protein  36.63 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31651  predicted protein  36 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386073  normal  0.188387 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  32 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08258  ubiquitin conjugating enzyme (UbcH), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04060)  28.24 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  37.08 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84844  predicted protein  28.22 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04010  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02212  ubiquitin conjugating enzyme (UbcA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07040)  28.47 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0396223 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30092  predicted protein  31.9 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0588671  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  29.51 
 
 
158 aa  72  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  25.19 
 
 
165 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  29.7 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10365  ubiquitin conjugating enzyme (UbcB), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12850)  28.86 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121391  normal  0.667928 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01159  ubiquitin conjugating enzyme E2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11410)  32 
 
 
470 aa  69.7  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  25.36 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  26.09 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_5608  predicted protein  33.67 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02210  ubiquitin-conjugating enzyme e2-18 kda, putative  30.21 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00226  ubiquitin conjugating enzyme (UbcC), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09200)  29.63 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.491024  normal  0.950814 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05351  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  29.14 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33350  predicted protein  26.5 
 
 
159 aa  62.4  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.386657  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03030  ubiquitin conjugating enzyme, putative  26.67 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0295747  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  25.55 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0194964  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07577  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15040)  27.41 
 
 
449 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116566  normal  0.884772 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36882  predicted protein  22.41 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  25 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07338  ubiquitin conjugating enzyme (UbcF), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16470)  24.16 
 
 
334 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0200334  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>