47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36882 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_36882  predicted protein  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02413  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13690)  38.03 
 
 
151 aa  96.7  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04250  hypothetical protein  49.33 
 
 
139 aa  88.6  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  31.18 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  29.41 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  27.63 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  28.57 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  28.48 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  30.07 
 
 
137 aa  60.1  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  25.9 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  26.67 
 
 
152 aa  58.9  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  26.81 
 
 
153 aa  57.8  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  26.24 
 
 
134 aa  57.8  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  24.5 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  30.67 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  28.66 
 
 
220 aa  55.1  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  39.62 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  25.35 
 
 
169 aa  54.7  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08258  ubiquitin conjugating enzyme (UbcH), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04060)  27.15 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_006686  CND02120  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
260 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  26.32 
 
 
167 aa  52  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  30.89 
 
 
157 aa  51.2  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  36.04 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  37.23 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  27.35 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  27.54 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  25 
 
 
197 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07577  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15040)  26.85 
 
 
449 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116566  normal  0.884772 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  25.15 
 
 
165 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  35.38 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33350  predicted protein  43.64 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.386657  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  24.83 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  32.48 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03030  ubiquitin conjugating enzyme, putative  24.03 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0295747  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  28.57 
 
 
181 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40298  predicted protein  22.4 
 
 
194 aa  44.7  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.297214  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  27.42 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12468  predicted protein  31.03 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.665817  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01020  E2 ubiquitin-conjugating enzyme, putative  24.3 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.105577  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84844  predicted protein  31.03 
 
 
242 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27762  predicted protein  47.5 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.613975  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05351  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  28.42 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  30.28 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00226  ubiquitin conjugating enzyme (UbcC), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09200)  40 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.491024  normal  0.950814 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  24.46 
 
 
220 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35186  predicted protein  22.64 
 
 
245 aa  41.2  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02210  ubiquitin-conjugating enzyme e2-18 kda, putative  41.3 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>