71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85060 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  100 
 
 
158 aa  328  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  61.18 
 
 
157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02210  ubiquitin-conjugating enzyme e2-18 kda, putative  60 
 
 
158 aa  204  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33350  predicted protein  56.86 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.386657  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27762  predicted protein  58.55 
 
 
160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.613975  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  51.25 
 
 
173 aa  184  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  38.89 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  38.26 
 
 
169 aa  105  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  35.14 
 
 
147 aa  100  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  32.73 
 
 
167 aa  100  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  34.46 
 
 
147 aa  100  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  34.25 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  35.53 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  34.9 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08258  ubiquitin conjugating enzyme (UbcH), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04060)  33.54 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  35.71 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  38.4 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  33.78 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  33.76 
 
 
220 aa  89  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  34.71 
 
 
135 aa  87  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  33.33 
 
 
165 aa  87  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02120  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
260 aa  85.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  30.77 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  38.89 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48810  predicted protein  35.9 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183416  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  35.46 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  33.12 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  34.87 
 
 
220 aa  80.9  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  30.46 
 
 
192 aa  80.5  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  34.21 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  32.14 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0194964  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  40.22 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  29.22 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  32.87 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01020  E2 ubiquitin-conjugating enzyme, putative  36.27 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.105577  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03030  ubiquitin conjugating enzyme, putative  29.01 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0295747  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  35.07 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01159  ubiquitin conjugating enzyme E2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11410)  31.47 
 
 
470 aa  75.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  31.09 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12468  predicted protein  31.48 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.665817  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10324  NEDD8 conjugating enzyme (UbcL), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14430)  29.82 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315281  normal  0.17789 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84844  predicted protein  32.8 
 
 
242 aa  74.3  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40298  predicted protein  29.51 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.297214  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31651  predicted protein  34.43 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386073  normal  0.188387 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40340  predicted protein  30.57 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10365  ubiquitin conjugating enzyme (UbcB), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12850)  28 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121391  normal  0.667928 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05351  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  32.74 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00226  ubiquitin conjugating enzyme (UbcC), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09200)  30.4 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.491024  normal  0.950814 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02212  ubiquitin conjugating enzyme (UbcA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07040)  32.24 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0396223 
 
 
-
 
NC_006686  CND04010  conserved hypothetical protein  31.86 
 
 
246 aa  67.4  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30092  predicted protein  28.33 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0588671  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_5608  predicted protein  29.91 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00500  hypothetical protein  30.08 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57900  predicted protein  30.83 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309908  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  33.57 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01761  ubiquitin conjugating enzyme Ubc8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09160)  31.53 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48883  predicted protein  31.75 
 
 
414 aa  50.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36882  predicted protein  27.35 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07577  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15040)  27.48 
 
 
449 aa  48.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116566  normal  0.884772 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05830  conserved hypothetical protein  33.65 
 
 
927 aa  47.4  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00168148  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34833  predicted protein  33.82 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00870  conserved hypothetical protein  24 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01270  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
920 aa  44.7  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10874  ubiquitin-conjugating enzyme Ubc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04612)  27.12 
 
 
277 aa  44.7  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56437  predicted protein  29.17 
 
 
355 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34709  Ubiquitin-conjugating enzyme variant MMS2 (UEV MMS2)  23.86 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37077  predicted protein  28.91 
 
 
222 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35186  predicted protein  28.46 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29356  predicted protein  30 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03136  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13060)  29.67 
 
 
1070 aa  42.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.460708  normal  0.136917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>