35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF00870 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF00870  conserved hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  312  9e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03644  protein involved in error-free postreplication DNA repair (Eurofung)  59.85 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291952 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34709  Ubiquitin-conjugating enzyme variant MMS2 (UEV MMS2)  56.93 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20308  predicted protein  43.07 
 
 
148 aa  122  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0878511  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34833  predicted protein  42.03 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  30.77 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  33.7 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  25.19 
 
 
169 aa  54.3  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  29.06 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  28.07 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  31.31 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  29.91 
 
 
181 aa  52  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  29.47 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  28 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  25.42 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  34.78 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  32.61 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  29.55 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  26.02 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  26.67 
 
 
135 aa  47  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  26.97 
 
 
134 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  27.59 
 
 
197 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  24 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  26.05 
 
 
220 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  28.75 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  27.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  36 
 
 
168 aa  43.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  23.13 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  27.4 
 
 
209 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0194964  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  26.88 
 
 
157 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  29.23 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  26.25 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  26.6 
 
 
173 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  24.47 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04010  conserved hypothetical protein  22.03 
 
 
246 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>