19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20308 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_20308  predicted protein  100 
 
 		 148 aa  311  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0878511  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03644  protein involved in error-free postreplication DNA repair (Eurofung)  45.26 
 
 		 141 aa  137  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.291952 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34709  Ubiquitin-conjugating enzyme variant MMS2 (UEV MMS2)  45.99 
 
 		 137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12113 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00870  conserved hypothetical protein  43.07 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34833  predicted protein  40.41 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.169117 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07338  ubiquitin conjugating enzyme (UbcF), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16470)  31.54 
 
 		 334 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0200334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  29.41 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  30.7 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  31.87 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_5608  predicted protein  31.33 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  25.89 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  34.67 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  28.92 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  29.47 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  28.33 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  28.41 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02212  ubiquitin conjugating enzyme (UbcA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07040)  36.07 
 
 		 246 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0396223 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  29.17 
 
 		 220 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30092  predicted protein  25.23 
 
 		 147 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0588671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>