41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34709 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_34709  Ubiquitin-conjugating enzyme variant MMS2 (UEV MMS2)  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.12113 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03644  protein involved in error-free postreplication DNA repair (Eurofung)  59.12 
 
 
141 aa  179  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291952 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00870  conserved hypothetical protein  56.93 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20308  predicted protein  45.99 
 
 
148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0878511  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34833  predicted protein  43.8 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  27.61 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  29.09 
 
 
169 aa  57.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  33.33 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  35.56 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  35.16 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  31.2 
 
 
220 aa  54.3  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  30.77 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  31.91 
 
 
192 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  30.53 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  35.63 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  27.19 
 
 
165 aa  52  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  34.48 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  32.26 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  27.01 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  35.23 
 
 
197 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04010  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
246 aa  50.4  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  33.01 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  25 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  26.92 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  35.16 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  28.89 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  26.67 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  40.26 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  28.85 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_5608  predicted protein  32.98 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27762  predicted protein  25.42 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.613975  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  23.86 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  27.64 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  30.49 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02212  ubiquitin conjugating enzyme (UbcA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07040)  30.48 
 
 
246 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0396223 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30092  predicted protein  27.59 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0588671  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31651  predicted protein  26.17 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386073  normal  0.188387 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01159  ubiquitin conjugating enzyme E2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11410)  33.02 
 
 
470 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10365  ubiquitin conjugating enzyme (UbcB), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12850)  32.94 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121391  normal  0.667928 
 
 
-
 
NC_006686  CND02120  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  40  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>