65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40340 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_40340  predicted protein  100 
 
 
174 aa  358  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  45.95 
 
 
160 aa  135  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  40.91 
 
 
168 aa  105  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  39.62 
 
 
149 aa  106  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  37.97 
 
 
147 aa  104  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  38.46 
 
 
147 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  39.74 
 
 
147 aa  99  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08258  ubiquitin conjugating enzyme (UbcH), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04060)  31.55 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  41.03 
 
 
147 aa  95.5  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  35.81 
 
 
220 aa  93.6  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  31.06 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  35.53 
 
 
169 aa  91.3  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  34.01 
 
 
197 aa  90.9  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  33.55 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  35.2 
 
 
192 aa  89  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  33.99 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10365  ubiquitin conjugating enzyme (UbcB), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12850)  29.14 
 
 
178 aa  87  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121391  normal  0.667928 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00226  ubiquitin conjugating enzyme (UbcC), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09200)  33.54 
 
 
225 aa  87  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.491024  normal  0.950814 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  30.67 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  35.37 
 
 
181 aa  84.3  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27762  predicted protein  34.44 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.613975  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  32.89 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  32.89 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  35.21 
 
 
150 aa  82  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  31.37 
 
 
220 aa  80.9  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  37.98 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02212  ubiquitin conjugating enzyme (UbcA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07040)  29.94 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0396223 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48810  predicted protein  36.54 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183416  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  35.25 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  29.01 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03030  ubiquitin conjugating enzyme, putative  30.43 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0295747  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84844  predicted protein  30.67 
 
 
242 aa  79  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  36.69 
 
 
159 aa  79  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  33.33 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30092  predicted protein  30.65 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0588671  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01159  ubiquitin conjugating enzyme E2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11410)  36.61 
 
 
470 aa  77.4  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40298  predicted protein  36.63 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.297214  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  38.53 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  31.65 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  32.8 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02120  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01761  ubiquitin conjugating enzyme Ubc8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09160)  33.02 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05351  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  29.81 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00500  hypothetical protein  31.86 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  30.57 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12468  predicted protein  32.08 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.665817  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31651  predicted protein  36.04 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386073  normal  0.188387 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57900  predicted protein  34.62 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309908  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01020  E2 ubiquitin-conjugating enzyme, putative  32.46 
 
 
177 aa  70.9  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.105577  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02210  ubiquitin-conjugating enzyme e2-18 kda, putative  26.45 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10324  NEDD8 conjugating enzyme (UbcL), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14430)  30.4 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.315281  normal  0.17789 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33350  predicted protein  28.66 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.386657  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  29.01 
 
 
209 aa  64.3  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0194964  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  25.93 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_5608  predicted protein  30.15 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04010  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 
246 aa  59.3  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35186  predicted protein  28.86 
 
 
245 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07338  ubiquitin conjugating enzyme (UbcF), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16470)  29.51 
 
 
334 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0200334  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  30.37 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  32.58 
 
 
297 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48512  predicted protein  26.19 
 
 
517 aa  44.3  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29356  predicted protein  25.2 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10874  ubiquitin-conjugating enzyme Ubc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04612)  24.6 
 
 
277 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56437  predicted protein  27.78 
 
 
355 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02413  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13690)  27.36 
 
 
151 aa  41.2  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>