19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48512 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48512  predicted protein  100 
 
 
517 aa  1065    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00482  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13940)  37.9 
 
 
1125 aa  87.4  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92865  predicted protein  34.06 
 
 
194 aa  63.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342805  normal  0.974666 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00226  ubiquitin conjugating enzyme (UbcC), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09200)  28.07 
 
 
225 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.491024  normal  0.950814 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  25.53 
 
 
181 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  28.24 
 
 
169 aa  50.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  28.1 
 
 
220 aa  50.1  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  30.14 
 
 
169 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  25.95 
 
 
149 aa  48.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02413  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13690)  26.47 
 
 
151 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  29.13 
 
 
153 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  36.36 
 
 
169 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  30.43 
 
 
197 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  25.45 
 
 
160 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  28.75 
 
 
137 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40340  predicted protein  26.19 
 
 
174 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05351  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  25.36 
 
 
168 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  30 
 
 
220 aa  43.5  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  24.09 
 
 
167 aa  43.5  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>