56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56437 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_56437  predicted protein  100 
 
 
355 aa  731    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07338  ubiquitin conjugating enzyme (UbcF), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16470)  46.67 
 
 
334 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0200334  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  42.6 
 
 
297 aa  146  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10549  predicted protein  58.72 
 
 
111 aa  143  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000151978  normal  0.856804 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35186  predicted protein  37.42 
 
 
245 aa  133  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37077  predicted protein  34.91 
 
 
222 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02130  ubiquitin-conjugating enzyme E2-28.4KD, putative  44.44 
 
 
162 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_56431  predicted protein  39.87 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0230302  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10874  ubiquitin-conjugating enzyme Ubc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04612)  34.62 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29356  predicted protein  36.03 
 
 
174 aa  90.1  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  34.15 
 
 
159 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22525  ubiquitin conjugating enzyme E2  33.93 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  28.67 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03030  ubiquitin conjugating enzyme, putative  31.82 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0295747  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  33.04 
 
 
147 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  33.61 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43750  predicted protein  31.69 
 
 
149 aa  67.4  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110987  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08258  ubiquitin conjugating enzyme (UbcH), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04060)  28 
 
 
166 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.718086 
 
 
-
 
NC_006686  CND02120  conserved hypothetical protein  30.25 
 
 
260 aa  63.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28433  predicted protein  27.44 
 
 
167 aa  63.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0449821  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  33.09 
 
 
169 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  30.83 
 
 
149 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10365  ubiquitin conjugating enzyme (UbcB), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12850)  26.92 
 
 
178 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121391  normal  0.667928 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08702  ubiquitin-conjugating enzyme (Eurofung)  32.48 
 
 
150 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03880  conserved hypothetical protein  29.41 
 
 
134 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7340  predicted protein  31.9 
 
 
137 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36198  predicted protein  28.8 
 
 
163 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.206579  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  25.81 
 
 
165 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27762  predicted protein  36.96 
 
 
160 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.613975  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68363  predicted protein  28.17 
 
 
152 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30911  predicted protein  27.74 
 
 
167 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0967023 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10994  ubiquitin conjugating enzyme (UbcJ), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01130)  29.84 
 
 
160 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  28.95 
 
 
153 aa  53.9  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  26.27 
 
 
181 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47555  predicted protein  27.83 
 
 
168 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.164115  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31727  predicted protein  29.82 
 
 
192 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0264606  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  28.23 
 
 
209 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0194964  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38691  predicted protein  31.75 
 
 
152 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430336  normal  0.981721 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  26.76 
 
 
169 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30389  ubiquitin-conjugating enzyme 1  34.88 
 
 
197 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57900  predicted protein  30.36 
 
 
190 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309908  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05351  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  30.19 
 
 
168 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30092  predicted protein  30.17 
 
 
147 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0588671  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02212  ubiquitin conjugating enzyme (UbcA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07040)  34.31 
 
 
246 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0396223 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05160  ubiquitin-conjugating enzyme e2-24 kda, putative  28.57 
 
 
220 aa  49.7  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04399  Ubiquitin carrier protein (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q52RL5]  33.06 
 
 
157 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71285  predicted protein  33.7 
 
 
220 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.205433  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48810  predicted protein  30.16 
 
 
220 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0183416  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24651  predicted protein  32.97 
 
 
173 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01761  ubiquitin conjugating enzyme Ubc8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09160)  25.7 
 
 
181 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  26.32 
 
 
169 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85060  predicted protein  29.17 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.540624 
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  28.43 
 
 
135 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01020  E2 ubiquitin-conjugating enzyme, putative  28.81 
 
 
177 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.105577  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02210  ubiquitin-conjugating enzyme e2-18 kda, putative  32.18 
 
 
158 aa  43.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40340  predicted protein  27.78 
 
 
174 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>