14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56431 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_56431  predicted protein  100 
 
 		 351 aa  727    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0230302  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56437  predicted protein  46.55 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07338  ubiquitin conjugating enzyme (UbcF), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16470)  35.64 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0200334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35186  predicted protein  31.52 
 
 		 245 aa  103  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0672692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02130  ubiquitin-conjugating enzyme E2-28.4KD, putative  36.22 
 
 		 162 aa  99.4  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37077  predicted protein  37.4 
 
 		 222 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03270  ubiquitin conjugating enzyme, putative  25.6 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10549  predicted protein  41.82 
 
 		 111 aa  92.8  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000151978  normal  0.856804 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10874  ubiquitin-conjugating enzyme Ubc6, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04612)  36.59 
 
 		 277 aa  90.5  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29356  predicted protein  34.95 
 
 		 174 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  27.48 
 
 		 147 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  23.78 
 
 		 147 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10724  predicted protein  28.22 
 
 		 169 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.36892  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15194  predicted protein  25.6 
 
 		 165 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.134584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>