13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02640 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA02640  expressed protein  100 
 
 
242 aa  497  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00883  ubiquitin-conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15570)  43.02 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.18822  normal  0.509658 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_8844  predicted protein  28.46 
 
 
149 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26750  predicted protein  29.29 
 
 
153 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182849  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02761  hypothetical protein similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2 isoform 2 (Eurofung)  30 
 
 
147 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.52239  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02760  ubiquitin-conjugating enzyme e2-16 kda, putative  28 
 
 
147 aa  48.9  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33325  predicted protein  24.32 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02770  hypothetical protein  26.06 
 
 
135 aa  46.2  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08010  ubiquitin-conjugating enzyme e2-17 kda, putative  31.51 
 
 
169 aa  45.4  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.54483  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47790  predicted protein  24.43 
 
 
169 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00101457  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80064  predicted protein  25 
 
 
147 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.441032 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38392  predicted protein  28.83 
 
 
159 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05495  ubiquitin conjugating enzyme (UbcK), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13170)  36.21 
 
 
181 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>